The movie is set on a state-of-the art Aegis vessel with the full cooperation of Japan's real-life Ministry of Defense and Maritime Self-Defense Force. The corpse of a Self-Defense Force member has been found — minus the left arm — and a spy has infiltrated the Aegis vessel. The heroine Ran is put in jeopardy, and Conan is forced to stand up against the dangerous Spy "X."
Shinichi Kudo, alias Conan Edogawa, devra résoudre une affaire de meurtre à bord d'un vaisseau militaire japonais ultra sophistiqué...
柯南、小蘭、毛利小五郎以及少年偵探團等人，一同參加了神盾艦的體驗航海活動，在日本海上自衛隊員的示範下，親眼見識到氣勢非凡的空中對戰演習。這時候，神祕的敵軍突然來襲，演習旋即變成了真實的激烈對戰!
小蘭與少年偵探團成員看到眼前的這一切，感到十分恐懼與不安。在海上自衛隊冷靜的應對處理下，戰況總算平息了下來，但是卻摸不清敵人的目的為何。這時，艦裏發現了一隻自衛隊員的左手殘肢，那隻手上戴了一隻時間停滯在上午5時30分的手錶……在如此不尋常的事態下，大阪府警方與京都府警方也緊急出動直升機前來現場，協力展開調查。而實際上並未登艦的女性自衛官──藤井七海，也在此時謎樣般的現身……
憑藉著犯人追踨眼鏡、最新偵探工具「衛星電話手錶」，以及在大阪的平次、和葉的協助下，柯南與灰原、阿笠博士對此一事件展間調查，赫然發現某國的間諜「X」竟然正潛伏在艦上!究竟間諜「X」是誰? 自衛隊員的左手、謎樣般的女性自衛官，他們之間又有甚麼關聯存在呢？在這艘神盾艦上所發生的事件，其實正蘊藏著一樁牽連日本全國的巨大陰謀！
Im Hafen von Maizuru wird ein verdächtiges Schiff entdeckt – vollgepackt mit Bomben. Am selben Ort freuen sich Conan und seine Freunde darauf, an Bord eines AEGIS-Kriegsschiffes zu gehen, um dort einen Tag lang öffentliche Manöver mitzuverfolgen. Der Alltag auf dem Zerstörer gestaltet sich allerdings eher langweilig – bis plötzlich ein seltsames Geräusch zu hören ist und ein unbekanntes Objekt auf dem Radar auftaucht. Conan bemerkt, dass das nicht zum Plan gehört, denn auch einige Gäste und Crewmitglieder verhalten sich verdächtig. Als im Filter des Pumpensystems zudem ein abgetrennter Arm gefunden wird, beginnt Conan mithilfe von Heiji Hattori zu ermitteln. Tatsächlich taucht auch bald die passende Leiche ohne Arm auf. Doch die Zeit zur Aufklärung ist knapp – Japan steuert bereits mit voller Fahrt auf eine nationale Krise zu …
京都舞鶴港沖、海上自衛隊によるイージス護衛艦"ほたか"の体験航海に参加したコナン一行。電子武装されたハイテク艦で繰り広げられる迫力の演習に、大興奮の子供たちだったが、訓練終了の直前に未確認物体が艦体に接近し、艦内に不穏な空気が流れ出す。"スパイX"というフレーズを聞きつけ、艦内を探るコナンは自衛隊員の左腕だけが発見された現場に遭遇。服部平次に協力を仰ぐと、今度は若狭湾の造船所で左腕のない遺体が発見され…。
La película se desarrolla en un buque Aegis de última generación con la plena cooperación del Ministerio de Defensa y las Fuerzas de Autodefensa Marítima de Japón en la vida real. Se ha encontrado el cadáver de un miembro de las Fuerzas de Autodefensa -sin el brazo izquierdo- y un espía se ha infiltrado en la nave Aegis. La heroína Ran se ve en peligro, y Conan se ve obligado a enfrentarse al peligroso espía "X".
Su un incrociatore delle forze di autodifesa giapponesi viene trovato il braccio mozzato di un ufficiale di marina. Sulla nave si trovano Conan, Ran, Kogoro, Sonoko, i Detective Boys e altri civili per assistere a una dimostrazione. Ran si trova in pericolo e Conan dovrà affrontare una spia infiltratasi sulla nave chiamata "X".
