The Megafauna prepares to launch into space and is attacked by new Capitol Guard mobile suits called Wuxia. The Wuxia's mission : to retrieve Bellri, Raraiya and G-Self from the Space Pirates. Arcane, supported by deflected Capitol Guard Catsith mobile suits, tries to defend the Megafauna. Miss Aida, piloting Arcane, gets into serious trouble when a Wuxia completely overpowers her and the Arcane. She is rescued by G-Self deploying a new prototype ground offensive pack. Director Wilmit Zenam (Bellri's mother) is heading into space together with his Holiness. Also onboard is Mask who has a mysterious meeting with the science program director. Meanwhile the Capital Space fleet launches to engage into battle in outer space.
法皇との会見場に母と父を残したベルリとアイーダ達は、ケルベスの誘導でビクローバーから離れてメガファウナに戻った。キャピタル・ガードの補給が完了したメガファウナは、キャピタル・テリトリィからの脱出を図るが、艦にはケルベスも護衛として残る。
一方、宇宙からの脅威について考えるところがあるという法皇は、クラウンでザンクト・ポルトに上がることを決断する。同行するウィルミット。グシオンはアメリア軍宇宙艦隊の出撃を止めるため、大気圏グライダーで帰国の途につく。
Ｇ-セルフとラライヤとベルリの保護をジュガンに命じられたベッカーは、キャピタル・アーミィが新造したモビルスーツ、ウーシァを擁して、メガファウナの前に立ち塞がる。ブリッジを脅かして要求を通そうとするベッカーは、アイーダのＧ-アルケインに阻まれて艦から引き離されるが、Ｇ系のモビルスーツに興味を示し、Ｇ-アルケインを略取しようとする。
ケルベスがキャピタル・アーミィから持ち出してきた陸戦用の高トルクパックをＧ-セルフに換装しようと奮闘するハッパ。調整が手間取り、出撃できないベルリは焦るが、アイーダの危機に、バックパックの調整が完了。ベルリは高トルクパックの出力に翻弄されつつも、機転を利かせてウーシァを撃退してアイーダを救った。
一方、ザンクト・ポルトへ向かう法皇のクラウンに調査部のクンパが現れ、ウィルミットはその動きを訝しむのだった。
卡尔贝斯中尉带贝尔利等人逃走，原来首都军不仅想要梅格法纳和G-Self，还想夺走拉莱雅。贝尔利和艾达他们尝试让梅格法纳逃离首都圈，但是却受到驾驶新型机动战士“巫夏”的部队的阻挠。梅格法纳遭到围攻，艾达陷入苦战，贝尔利前去援助。此时拉莱雅逐渐清醒，她所知晓的宇宙威胁到底是什么呢？
