こころの大樹を守るため、キュアムーンライトがダークプリキュアと戦っています。でも、おしくも敗れてしまいました。そこでキュアムーンライトは、次にこころの大樹を守るプリキュアのため、妖精のシプレとコフレにココロパフュームを渡します。・・・そんな夢を見た女の子、花咲つぼみ。お父さんとお母さんがフラワーショップを開店するため、おばあちゃんが住んでいる希望ヶ花市に引越ししてきた中学2年生です。つぼみは、引っ込み思案で内気な自分を変えたいと思って、私立明堂学園に転校してきました。登校途中で幸運の四葉のクローバーを見つけて、つぼみは気合十分になったのですが・・・