一(道枝駿佑)達が、舞台“オペラ座の怪人”を見るため、音楽家の響(霧島れいか)がオーナーをつとめるオペラ座館へとやってきた。ヒロイン役の人気女優、湖月レオナ(山本舞香)に会えることもあり美雪(上白石萌歌)も佐木(岩﨑大昇)も大喜び。 関係者によるレセプションの中、劇団を辞めた氷森(七瀬公)がレオナに接近するが、劇団員の三鬼谷(六角慎司)に激しく拒まれる。他の劇団員、いずみ(石川萌香)や城(増田昇太)も、レオナの引き抜きを異常に警戒していた。 やがてリハーサルが始まり、演出家の影島(コング桑田)の指示で、いずみがステージの中央に立つ。しかし次の瞬間、シャンデリアが落下し、いずみが絶命する…！ ライターの白神(戸塚純貴)は、館に潜むファントムという怪人の仕業だと言う。その影は、剣持警部(沢村一樹)やレオナの前にも現れ、新たな惨劇が起こってゆく…。 実は3年前、この劇団には火事で顔に大やけどを負いつつも、ファントムを熱演した天才俳優、霧生(古川雄大)がいた。後の不幸な運命から彼はファントムと呼ばれていて…。全ては嫉妬に身を焦がしファントムと化した霧生の仕業なのかと怯える劇団員。 オペラ座館の地下迷宮で一が見たものとは…！？
一（道枝駿佑飾）等人為了觀賞舞台劇“歌劇魅影”而來到由音樂家響（霧島麗香飾）所經營的歌劇院。美雪（上白石萌歌飾）與佐木（岩崎大昇飾）因為能見到飾演女主角的當紅女演員湖月蕾歐娜（山本舞香飾）而開心不已。 在由相關人員舉辦的招待會中，已離開劇團的冰森（七瀨公飾）試圖接近蕾歐娜，卻被團員的三鬼谷（六角慎司飾）嚴詞拒絕。其他團員的泉（石川萌香飾）和城（增田昇太飾）也對別人要來挖角蕾歐娜一事抱持著異常警戒的態度。 彩排終於開始，在舞台導演影島（孔骨桑田飾）的指示下，泉站到舞台中央。但就在下個瞬間，掉落的水晶燈竟讓泉喪命！撰稿人白神（戶塚純貴飾）說這是潛伏在歌劇院裡名為魅影的可疑人士所為。而魅影之後也出現在劍持警部（澤村一樹飾）和蕾歐娜面前，引發一件又一件的悲慘事件。 其實在3年前，此劇團曾有一位因火災而造成臉部嚴重燒傷卻仍熱情演出魅影一角的天才演員霧生（古川雄大飾）。之後他所遭遇的不幸命運讓他被稱作魅影。劇團團員們害怕這一切都是霧生因忌妒化為魅影後下的毒手。 而一在歌劇院的地下迷宮中又會看到什麼？
Kindaichi and friends visit an opera house to see a live performance of The Phantom of the Opera. Miyuki and Saki are excited to meet the famous actress Leona Kozuki, who plays the heroine. During the reception for theater members, Himori, who had left the theater company, approaches Leona, but is harshly rejected by Mikitani, a current theater company member. The other company members Izumi and Jo are also on high alert against Leona being scouted by another company. Eventually, rehearsal begins, and Izumi takes center stage under Director Kageshima's instruction. However, the very next moment, the chandelier falls down, taking Izumi's life. Shiragami, a journalist, claims that it was no accident, but the work of the Phantom who lurks within the opera house. The Phantom's shadow appears before Leona and Inspector Kenmochi, and further tragedy ensues. Kindaichi then learns about Kiryu, a prodigy actor who played the Phantom on that same stage three years ago.
