後藤英雄（東山紀之）が企画した『新生アミー＆ゴー』のコンサートが目前に迫り、名峰病院の医局では、漆原誠司（生瀬勝久）、町谷玲奈（小池栄子）、後田淳（吉沢悠）らが小向桃子（多部未華子）にダンスの練習を強いられていた。 そんな中、氷室慎太郎（椎名桔平）の元妻・多恵（清水美沙）が高熱で倒れ、全身の倦怠感、咽頭痛を訴えてソウシンの診察室へ運び込まれる。さらに、多恵と同じような症状を訴える患者やスタッフ、付き添い人が続出！「院内感染の疑いもある」と、病院内は騒然となる。 さらに、騒動のさなか、事務長・曽根智雄（八嶋智人）の陰謀によって、名峰病院の所有権が上海ウエストメディカルセンターに売却され、院長の大山剛三（大和田伸也）が解任されるというゆゆしき事態が発生。曽根は、水面下で中国のリネンメーカーと手を握り、ソウシンを含む採算の合わない部署を廃止して、新たに富裕層向けの人間ドッグを作ることを前々から企んでいたのだ…。 理事に昇格した曽根から「これが最後の仕事だ」と言い渡されたソウシンのメンバーたちは、全力で「院内感染」の原因究明に奔走することになる。インフルエンザか、SARS（サーズ）か…情報が錯綜し、ますます混乱する状況下で、ついには桃子までもが倒れてしまい…！？ 果たして名峰病院、そして総合診療科の運命とは？そして、後藤はコンサートのステージに立つことができるのか？感動の最終回！！乞うご期待