Le réseau des trafiquants de drogue de Lyon, dirigé par Francis Paoli, est aussi puissant qu'impénétrable. Toutes les méthodes traditionnelles utilisées par la police pour le démanteler se sont révélées inefficaces. De nombreux enquêteurs se sont épuisés à suivre les revendeurs, établir des liens, dresser des organigrammes, sans pour autant parvenir à faire tomber les cerveaux. Madame la commissaire Mazoyer, lasse d'être la risée des criminels, négocie avec le parquet pour mettre au point un ultime plan d'attaque. Sa nouvelle approche du problème, pense-t-elle, devrait permettre l'arrestation de tous les malfrats, du simple lampiste au gros bonnet...
Costa et Roman initient Alice Dornier, l'ex-maîtresse de Paoli, aux techniques d'espionnage, avant de l'envoyer infiltrer le réseau du trafiquant. Costa la prépare minutieusement à la tâche difficile qui sera la sienne. La jeune femme doit intégrer les consignes de sécurité indispensables : codes de communication secrets, procédures d'urgence en cas de problème, micro-émetteur à dissimuler, rien n'est laissé au hasard. Les résultats ne tardent pas à tomber...
Manin a été arrêté par les hommes du commissaire Mazoyer. Mis en cellule, il attend d'être interrogé. Hélas, les gardiens le retrouvent pendu quelque temps plus tard. Informés par Alice, Costa et Roman se lancent sur une nouvelle piste, apparemment prometteuse. Un Russe du nom de Kaniev, gros trafiquant d'héroïne, doit bientôt arriver à Lyon. Les enquêteurs soupçonnent Francis Paoli de vouloir conclure une alliance avec la prospère mafia russe. Pour récolter de nouvelles informations, Alice est contrainte de prendre de plus en plus de risques...
Paoli est désormais l'objet de toutes les attentions de la police. Une équipe spéciale est chargée de le suivre en permanence, où qu'il se rende. Mais il parvient à échapper aux limiers. Désespérée par sa rupture avec Costa, Alice finit par répondre aux avances du malfrat, qui la manipule pour se forger un alibi imparable. Alice est alors accusée par la cellule d'être passée à l'ennemi...
Costa et Roman, à force de recherches intensives, réussissent à identifier une pièce maîtresse de l'organisation mafieuse : le banquier véreux Jourdan. Ils décident de mettre cette information à profit et tentent de pousser Paoli à la faute en faisant pression sur le banquier du réseau. A l'aide d'un pirate informatique, ils repèrent les mouvements d'argent révélateurs d'opérations de blanchiment. Pour compromettre Jourdan, ils vident un des comptes d'une société liée à Paoli. Déstabilisé, Jourdan craque et accepte de lâcher Paoli. Ce dernier tente d'assassiner les policiers, mais ne réussit qu'à blesser Roman...
La police retrouve le corps sans vie de Paoli. De son côté, Alice, qui purgeait une peine au pénitencier le plus proche, est libérée. Convaincue qu'elle sera en danger tant que les associés de Paoli n'auront pas été arrêtés, elle décide pourtant, contre l'avis de Costa et Roman, de réinfiltrer le milieu. La jeune femme ignore que le bras droit du défunt est au courant de son double jeu. Le malfrat l'utilise perfidement pour tromper la police...
Après la mort de Paoli, Roman et Costa doivent agir vite pour arrêter tous les membres de son réseau, avant qu'ils disparaissent. Costa rencontre Yohann, un garçon qui lave les pare-brise des voitures à un carrefour. Il est arrivé en France avec sa mère mais rapidement, il a été séparé d'elle.
Au prix de risques énormes et de grosses tensions au sein de l'équipe, le réseau Paoli est enfin complètement démantelé. Au terme de cette mission réussie, les hommes de la cellule espèrent enfin reprendre leur souffle. Yohann est toujours à la recherche de sa mère mais cette fois, il est aidé par Costa et Roman.