Zero verlies mitten im finalen Kampf das Schlachtfeld… alle halten ihn für einen Verräter, selbst Lelouch, der sich an nichts mehr erinnern kann, ist von Zero nicht gerade begeistert. C.C. versucht ihn wieder an seine eigentliche Rolle zu erinnern.
One year after the Black Rebellion, Lelouch Lamperouge has resumed his normal school life with no apparent memories of the year before. After skipping remedial gym class, he sets off with younger brother Rolo to gamble at Babel Tower. Led by C.C., the Order of the Black Knights launches an attack on the complex to retrieve Lelouch. C.C. reawakens Lelouch's memories, and he resumes his identity as Zero. Suzaku Kururugi declares to the Emperor that he will personally kill Zero.
Lelouch mène un vie normale d'étudiant, n'ayant aucun souvenir de l'influence qu'il a eu dans la rébellion japonaise. Rébellion matée par Britannia après l'annonce de la mort de Zero.
Mais le jeune homme n'est cependant pas un citoyen pur et dur, qui mépriserait les Eleven.
Mais alors que des émissaires chinois sont en visite à tokyo, les quelques Chevaliers Noirs encore en liberté préparent une opération de la dernière chance...
La seconda serie ha inizio un anno dopo la Black Rebellion, finita con la sconfitta dei ribelli giapponesi. La scena si sposta sull'Ashford, e nell'istituto vediamo Lelouch immerso in una ordinaria vita da studente, ma immediatamente si notano diverse incongruenze: Nunnally, sorella del protagonista, sembra scomparsa dalle menti di tutti e al suo posto troviamo un fratello minore, Rolo; Villetta Nu, pilota di Knightmare al servizio dell'esercito britanno (che nel passato, avendo perso la memoria aveva amato Kaname Ōgi, vice-comandante di Zero, ma che poi avendo riacquistato i ricordi non aveva esitato a sparargli ferendolo gravemente durante la Black Rebellion), è adesso una insegnante di educazione fisica; Shirley, benché le fosse stata rimossa la memoria da Lelouch riguardo a tutti i ricordi sulla loro relazione, è tornata ad amarlo; Lelouch sembra non ricordare più nulla di tutto ciò che era accaduto nella prima serie, inclusa la sua doppia identità come Zero e il suo passato come principe britanno. Lelouch si reca alla Babel Tower per disputare una partita a scacchi, ma improvvisamente quella che sembra essere l'ultima cellula terroristica dei Cavalieri Neri attacca l'edificio, decisa a recuperare Lelouch e farlo tornare alla guida dei ribelli. L'edificio viene immediatamente circondato dall'esercito britanno, ma C.C. riesce a far recuperare la memoria a Lelouch prima che egli venga ucciso. Recuperati i ricordi e l'uso del Geass, Zero stermina i soldati giunti per ucciderlo.
「黒の騎士団」を先鋒とした日本人の一斉蜂起事件「ブラックリベリオン」から一年。アッシュフォード学園に通うルルーシュは、ある日、弟のロロと共にバベルタワーにある賭けチェスに赴いた。その時、タワーに近づく飛行船。それこそ卜部とC.C.が率いる黒の騎士団残存部隊の乾坤一擲のある作戦のスタートだった…。
Lelouch Lamperouge regressa à vida habitual de estudante preguiçoso e jogador, agora que a sua memória foi apagada e preenchida com recordações falsas.
Ha pasado un año desde la Rebelión Negra. Lelouch vive tranquilamente junto con su hermano Rolo, con quién asiste a una partida de ajedrez. En edificio donde se encontraban es atacado por la Orden de los Caballeros Negros logrando hacer que C.C. llegue hasta Lelouch. La bruja lo besa y hace recuperar sus recuerdos.
魯路修（zero）在山洞中被朱雀抓住並被獻給不列顛國王查爾斯·D·不列顛（魯路修的父親），查爾斯使用geass消除了魯魯修有關zero的記憶，並在身邊安排了人員監視魯路修（zero宣布已死）；魯路修在恐怖襲擊時由CC的一吻解開了封印的記憶……
Спустя год после Черного Восстания, Лелуш Ламперуж возобновил свою обычную школьную жизнь без видимых воспоминаний о прошлом году. Пропустив занятия физкультурой, он отправляется с младшим братом Роло играть в Вавилонскую башню. Возглавляемый Си Си, Орден Черных рыцарей начинает атаку на комплекс, чтобы вернуть Лелуша. Си Си пробуждает воспоминания Лелуша, и он снова становится Зеро. Сузаку Куруруги заявляет императору, что лично убьет Зеро.
