Lelouch erhielt seine Erinnerung von C.C. zurück und belebte die Rebellion gegen Britannien von Neuem. Karen konnte jedoch es immer noch nicht verarbeiten, dass Lelouch in Wirklichkeit Zero sein soll...
Lelouch directs the Black Knights in a counterattack against the Britannian forces and recalls how he came to forget his past: after Suzaku arrested him and brought him back to Britannia a year ago, the Emperor used his Geass to implant false memories in Lelouch's mind. The new Knightmare Frame prototype Vincent arrives and wreaks havoc on the Black Knights. They collapse Babel Tower to retreat, simultaneously dropping it on Viceroy Carares and creating a road straight to the Chinese Federation Consulate, where the Black Knights escape to. Zero broadcasts his plan to recreate the United State of Japan. The Britannian military retreats, but the pilot of the Vincent, Rolo, is not so easily swayed. After arriving at the consul grounds, he confronts Li Xingke, revealing that he too possesses the power of Geass.
Lelouch a retrouvé toute sa mémoire : sa capture par Suzaku, et la découverte du Geass de l'Empereur. Et qui est ce frère qu'il n'a jamais eu ?
Pour le moment, les forces Britanniennes encerclent la tour de Babel et se préparent à l'assaut. Heureusement, un plan d'évasion a été organisé par C.C. et Diethar pour l'évasion, le génie de Lelouch faisant le reste.
Mais une imprévu survient : un mystérieux Knightmare de la même classe que le Lancelot, mais d'une rapidité qui dépasse les limites de la physique...
Scopriamo in tal modo che Lelouch era stato sconfitto e catturato da Suzaku il quale lo aveva condotto innanzi all'imperatore di Britannia, ottenendo in tal modo il titolo di "Knight of the Rounds", uno dei più potenti piloti di Knightmare ai diretti ordini dell'imperatore stesso. I ricordi del protagonista erano stati rimossi dal Geass dell'imperatore di Britannia, e quest'ultimo lo aveva lasciato in vita per utilizzarlo come esca per i membri dell'ordine dei Cavalieri Neri sfuggiti alla cattura.Improvvisamente compare un nuovo Knightmare nemico, basato sul modello del Lancelot, che fa strage dei seguaci di Zero; a fermarlo sarà Urabe, uno degli Shisei-ken (traducibile in "spada sacra", egli era uno dei quattro sottoposti del colonnello Tōdō), che si sacrificherà per salvare Lelouch. A questo punto la torre viene fatta esplodere dai ribelli, facendo sì che i Knightmare nemici arrivati dall'alto si schiantassero al suolo, e contemporaneamente che i resti dell'edificio crollassero uccidendo il governatore generale Calares. Sfruttando le macerie come una sorta di ponte, i Cavalieri Neri trovano rifugio nell'ambasciata Cinese, e da qui Zero annuncia nuovamente al mondo intero il suo desiderio di combattere l'impero di Britannia.
神根島で放たれた銃弾の末は？ 果たして、ルルーシュとスザクに何があったのか？ そして今、ルルーシュ変貌の秘密が明かされる…。戦場と化したバベルタワー内で激戦を繰り広げる黒の騎士団の前に出現した謎のナイトメアフレーム。その脅威の戦闘力に黒の騎士団は、絶体絶命の窮地に追い込まれて…。
Lelouch recupera a memória e lidera a Ordem dos Cavaleiros Negros. Após tomarem a Torre de Babel, os Cavaleiros são atacados por uma nova Frame.
Lelouch recuerda lo que pasó, incluso como fue que le implantaron falsos recuerdos. Convirtiéndose nuevamente en Zero, Lelouch organiza un plan de ataque para salir del edificio y asesinar a Carares, el nuevo Gobernador General del a área 11. Cumple su plan y pide asilo en la embajada de la Federación China (usando su geass). Tras esto, interviene las líneas de televisión anunciando su regreso.
魯路修用巧妙的戰術打敗了東京租借監督，並在中華聯邦的大使館（這是已經換成了CC，魯路修已經返回了學院）向不列顛宣布日本獨立計劃，羅洛（安排的監視人員，虛擬的弟弟）趕到中華聯邦要來殺敵zero。
