Charles ist zurück. Lelouch hat sich verrechnet. Während er als Zero bereits den Krieg um Japan ausgerufen hat, bedeutet die neue Entwicklung eine Gefahr für seine Schwester Nunnally, die Gouverneurin von Area 11 ist und leicht als Druckmittel gegen ihn eingesetzt werden könnte.
In seiner Not wendet sich Lelouch an die einzige Person, der er Nunnallys Leben anvertrauen würde: Suzaku. Da Zero für Euphies Tod verantwortlich ist, sieht Suzaku keinen Grund, warum er helfen sollte. Er will seinem ehemaligen Freund dennoch die Möglichkeit geben, zu bereuen und seine Fehler zu bereinigen.
Doch dann kommt es zu einem verhängnisvollen Ereignis...
The battle for Japan gets underway, and it does not start out well for the Black Knights. Luciano and Bismark decimate their ranks, with only Li Xingke to keep them at bay. Suzaku and Lelouch meet to discuss Nunnally. After some initial animosity, Lelouch manages to win Suzaku over. However, Schneizel has his personal guard arrest Lelouch, making Lelouch believe Suzaku has betrayed him. Schneizel and Lelouch have a private chat, and Lelouch is rescued by none other than Guilford, having used his Geass on Guilford beforehand to make him believe he is Cornelia. Using the Gefjun Disturber train network, Lelouch shuts down the Tokyo Settlement. At the same time, his reinforcements emerge from the ocean, ready to take advantage of the opportunity. Meanwhile, the Emperor is preparing for Ragnarök.
Tandis que les Chevaliers Noirs, guidés par Li Xing-ke, attaquent le Japon afin de le reprendre à Britannia, Lelouch se rend au temple Kururugi pour rencontrer Suzaku. Prêt à tout pour sauver Nunnally, il se heurte à un mur : Suzaku l'oblige à avouer tous ses crimes et plus encore, car Lelouch assume des choses qu'il n'a pas commis. Le lien entre les deux semble définitivement rompu.
Mais à leur grande surprise, ils découvrent que Kururugi a été suivi...
L'ordine dei cavalieri neri si prepara a combattere per conquistare il Giappone, in quanto in caso di vittoria le nazioni sotto il dominio britanno insorgeranno contro l'impero. Mentre sul fronte vediamo impegnate in battaglia le forze ribelli guidate da Xingke e quelle britanne supportate dal Knight of One Lord Bismarck Waldstein e dal Knight of Ten Lord Luciano Bradley, Lelouch si incontra con Suzaku. Il giapponese gli rinfaccia i suoi peccati, e il principe ribelle se li addossa dal primo all'ultimo (anche la colpa per eventi accaduti non per sua volontà), ma afferma di non poter cambiare le cose a questo punto. Per arrivare finalmente a un mondo migliore, Suzaku decide di aiutarlo un'ultima volta, quando all'improvviso dei soldati britanni fanno la loro apparizione, arrestando Lelouch. Zero, convinto di essere stato tradito ancora una volta da quello che considerava un amico, sfrutta un Geass precedentemente imposto su un soldato britanno (Lord Guilford, cavaliere della principessa Cornelia) per fuggire e dirigersi verso Tokyo. A questo punto Zero dà inizio all'attacco della città.
戦場は再びエリア11へ。黒の騎士団とブリタニア軍の最強部隊との戦いが始まろうとしていた。だが、その最中ルルーシュは独り枢木神社へと向かう。スザクと会う為に。今、ナナリーを救えるのは彼しかいない。思い出の地で邂逅した二人。だが…、どうするルルーシュ！ どうするスザク！
Enquanto tenta salvar Nunnally, Lelouch joga a sua última cartada, implorando humilde e desesperadamente a Suzaku que o ajude.
Leouch recurre a Suzaku en un intento por garantizar la seguridad de Nunally durante el asalto que la Orden de los Caballeros Negros planea hacer contra Tokyo. Sin embargo Schneizel intercepta la comunicación y usa la oportunidad para capturar a su hermano menor.
在11區, 一場黑騎士團與帝國最強的軍隊之間的戰役將要開始。同時, 為了娜娜莉, 魯路修向樞木家的神社走去, 朱雀在那兒等候。他們的見面醞釀著種種想法, 他們的命運將在何方? 魯路修和朱雀決定再次聯手時卻…
