Lelouch ist zurück. Nach der Vernichtung von Charles besteigt er als 99. Thronfolger den Königsthron Britannias. An seiner Seite: Suzaku als sein pesönlicher Ritter und frisch ernannter Knight of Zero. Sogleich macht sich der neue König daran, Britannia komplett umzukrempeln, schafft alle Adelstitel und Geburtsrechte ab und lässt alle kolonialisierten Länder in die Freiheit. Dadurch steigt sein Ansehen in der Welt gewaltig. Als er jedoch auch noch der Supranationalen Föderation beitreten will, klingeln bei den Schwarzen Rittern die Alarmglocken, denn die Mitgliedschaft Britannias würde einer Herrschaft Lelouchs über die ganze Welt mit sich bringen...
Lelouch begins his reformation of Britannia, abolishing the aristocracy and Area system. The Knights of Rounds attempt to remove Lelouch from power, but Suzaku, piloting the Lancelot Albion, easily obliterates their ranks, killing Bismarck Waldstein and two other Rounds members while only disabling Gino's Knightmare. His position secure, Lelouch announces his intention to join the U.F.N. On the way to the meeting, he and Kallen bid each other farewell after she kisses him, Kallen having been unable to get Lelouch to answer any of her questions. When the UFN demands that he accept a limit to his voting power to prevent Britannia from attaining an automatic majority, Lelouch forces their hand by having Suzaku take the U.F.N. leaders hostage and Britannia's military surround Japan. During the commotion, the Britannian capital is obliterated by Schenizel, who is aboard his new flying fortress, the Damocles. He reveals to Lelouch that Nunnally is alive, and she declares herself to be Lelouch and Suzaku's enemy.
L'Empereur Lelouch s'est rapidement rendu populaire en abolissant tout un tas de privilèges de l'aristocratie et en donnant leur liberté à tous les territoires conquis et transformées en "nombres". De leur coté, les Chevaliers noirs ne savent que penser : est-il leur ennemi ou leur allié ? Œuvre-t-il dans le même sens qu'eux ou pour son compte personnel ?
A leur grande surprise, Lelouch demande à ce que Britannia intègre la Fédération des Nations Unies. Cela doit s'effectuer par un vote au deux tiers des représentants et Lelouch demande à ce que la rencontre ait lieu à l'Académie Ashford.
Les Chevaliers Noirs préfèrent rester méfiants, notamment Kallen, chargé d'accueillir l'empereur et qui attend toujours la réponse à la question qu'elle lui avait posée...
Le guardie intervengono per catturarlo, ma a fermarle è Suzaku, presentato da Lelouch come suo cavaliere personale, più potente degli stessi Knights of the Rounds, tanto da avere il titolo di "knight of Zero". Immediatamente dopo, utilizzando il suo geass, Lelouch fa sì che i nobili nella sala del trono lo acclamino come legittimo successore al trono. Lelouch si è impossessato del trono Imperiale, ma la sua posizione come 99º Imperatore è contestata dai nobili britanni in quanto il giovane ha dato inizio all'attuazione di riforme clamorose quali l'annullamento dei titoli nobiliari, il riconoscimento dei diritti dei Numbers (cittadini non britanni di una delle aree conquistate, e sfruttati in quanto sottomessi, come ad esempio gli Eleven) portando alla totale distruzione-ricostruzione dell’Impero. Nel frattempo Schneizel e Cornelia sono spariti dalla circolazione, mentre i Cavalieri Neri provano a capire le intenzioni di Lelouch e la loro prossima mossa. Nel frattempo, all’Accademia Ashford, Milly e Rivalz stanno nascondendo Nina dagli occhi del pubblico poiché la creazione del F.L.E.I.J.A. ha attirato verso di lei l'odio di tutti. La scena si sposta sul giardino del palazzo imperiale, dove Lelouch e Suzaku stanno parlando di quello che ha compiuto Lelouch da quando è diventato Imperatore, e anche di ciò che avverrà in futuro. Lelouch dice al suo cavaliere che ben presto causerà innumerevoli massacri, tanto da oscurare il nome di Euphemia come Principessa Sanguinaria affinché nessuno si ricordi della strage compiuta da lei. Lelouch dice che per Euphie e per Nunnally dovranno conquistare il mondo, per attuare lo "Zero Requiem". Ma mentre stanno ancora discutendo riguardo alle possibili future mosse di Schneizel, legate probabilmente a misteriosi movimenti all'interno dell'istituto scientifico di Toromo, il palazzo imperiale subisce un improvviso attacco da parte dei Knights of Rounds che sono rimasti fedeli a Charles e non accettano Lelouch come loro I
世界は変貌を遂げようとしていた。超合集国とブリタニア帝国。二極化した力の激突は避けられないのか？ それとも…。多くの人間の運命が変転し絡み合い新たな物語を紡ぎ、いよいよクライマックスへと突入する!!
Lelouch, agora declarado imperador, destrói tudo o que até então representou a Britannia, com o consentimento de Suzaku.
La modalidad de Lelouch como Emperador sorprende incluso a los Caballeros Negros. Ante esto, Lelouch decide unir a Britannia cona la Federación de Naciones Unidas en la Academia Ashford, todo esto a la fuerza. A su vez, Schneizel destruye la capital de Pendragon con su reciente fortaleza aérea Damocles, y revelando ante Lelouch y Suzaku, la supervivencia de la Gobernadora Nunally.
魯路修繼任不列顛尼亞皇帝后完全的重組了不列顛尼亞，朱雀擊敗來犯的4名圓桌騎士。魯路修決定加入超合眾國，在阿什弗德學院內將超合眾國全體要員作為人質要求，同時修奈傑爾啟動了達摩克里斯並否定魯路修作為皇帝，而修奈傑爾口中更適合的人選竟是娜娜莉。
