| Name | First Aired | Runtime | Image | |
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| S06E01 |
集められた名探偵！工藤新一ＶＳ怪盗キッド
season finale
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January 8, 2001
YTV (JP)
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100 | |
| S06E02 | 偽りだらけの依頼人（前編） |
January 15, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E03 | 偽りだらけの依頼人（後編） |
January 22, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E04 | そして人魚はいなくなった（事件編） |
January 29, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E05 | そして人魚はいなくなった（推理編） |
February 5, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E06 | そして人魚はいなくなった（解決編） |
February 12, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E07 | 商売繁盛のヒミツ |
February 19, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E08 | バトルゲームの罠（前編） |
February 26, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E09 | バトルゲームの罠（後編） |
March 5, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E10 | 殺意の陶芸教室（前編） |
March 12, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E11 | 殺意の陶芸教室（後編） |
March 19, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E12 | 謎めいた乗客（前編） |
April 16, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E13 | 謎めいた乗客（後編） |
April 23, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E14 | マンション転落事件 |
May 7, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E15 | 消えなかった証拠（前編） |
May 14, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E16 | 消えなかった証拠（後編） |
May 21, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E17 | 密室のワインセラー |
May 28, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E18 | 南紀白浜ミステリーツアー（前編） |
June 4, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E19 | 南紀白浜ミステリーツアー（後編） |
June 11, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E20 | 大阪“３つのK”事件（前編） |
June 18, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E21 | 大阪“３つのK”事件（後編） |
June 25, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E22 | 新幹線護送事件（前編） |
July 2, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E23 | 新幹線護送事件（後編） |
July 9, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E24 | 元太少年の災難 |
July 16, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E25 | 毛利小五郎のニセ者（前編） |
July 23, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E26 | 毛利小五郎のニセ者（後編） |
July 30, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E27 | ヒマワリ館の銃声 |
August 6, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E28 | 網にかかった謎（前編） |
August 13, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E29 | 網にかかった謎（後編） |
August 20, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E30 | 癒しの森のアリバイ |
August 27, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E31 | アイドル達の秘密（前編） |
September 3, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E32 | アイドル達の秘密（後編） |
September 10, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E33 | OK牧場の悲劇 |
September 17, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E34 | 絵の中の誘拐犯 |
October 8, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E35 | 本庁の刑事恋物語４（前編） |
October 15, 2001
YTV (JP)
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| S06E36 |
本庁の刑事恋物語４（後編）
season finale
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October 22, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E37 | 松江玉造連句14番勝負（前編） |
October 29, 2001
YTV (JP)
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| S06E38 | 松江玉造連句14番勝負（後編） |
November 5, 2001
YTV (JP)
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| S06E39 | 世にも奇妙な天罰 |
November 12, 2001
YTV (JP)
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25 | |
| S06E40 | シカゴから来た男（前編） |
November 19, 2001
YTV (JP)
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| S06E41 | シカゴから来た男（後編） |
November 26, 2001
YTV (JP)
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| S06E42 | 揺れるレストラン |
December 3, 2001
YTV (JP)
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| S06E43 | 雪の夜の恐怖伝説（前編） |
December 10, 2001
YTV (JP)
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| S06E44 |
雪の夜の恐怖伝説（後編）
season finale
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December 17, 2001
YTV (JP)
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