Es stellt sich heraus, dass Codys verstorbener Vater Oikawas einziger Freund gewesen ist. Als Oikawa das herausfindet, kann er Cody nicht angreifen und verschwindet. Als der Samen der Finsternis in der Schülerin Noriko zu keimen beginnt, stehen sich Cody und Oikawa wieder gegenüber. Oikawa absorbiert die Blume, die aus Noriko herauswächst, und gewinnt an Power. Codys Großvater Chikara kommt und bietet Oikawa seine Freundschaft an. Der ässt sich aber nicht überzeugen. BlackWarGreymon beschließt stark geschwächt, seine letzte Kraft aufzuwenden, um das Tor im Westendviertel zu versiegeln. Es gelingt ihm, doch es kostet ihn das Leben.
BlackWarGreymon finally realizes his destiny, to make sure no one can use the Highton View Terrace gate again. Will the digi-destined help him out, or do they think he has another destiny?
ふとしたことからデジモンのことを祖父に知られてしまう伊織。だが祖父は、殉職した伊織の父が少年時代からデジタルワールドの存在を信じていたことを告げる。一方、一人の子供に植えつけられていた“暗黒の種”が花開こうとしていた。及川と伊織の父の意外な関係とは!?
Los niños elegidos de las 2 temporadas siguen vigilando a los niños infectados con la semilla de la oscuridad. No obstante, en una niña de nombre Noriko está germinando más rápido. Mientras, Yukio Oikawa recuerda al padre de Cody, el ya fallecido Hiroki Hida, en especial cuando soñaban que existía un mundo digital. Al otro día, la semilla de Noriko crece y se vuelve una flor que es absorbida por Oikawa, tras esto la niña cae inconsciente.
Les spores noires d’un des enfants grandissent en une fleur noire. Le grand-père de Cody tente de convaincre Oikawa d’abandonner sa méchanceté, mais il échoue. Avant qu’Oikawa ne le tue, cependant, BlackWarGreymon se sacrifie et prend le coup. Le digimon méga mourant tente d’utiliser ses dernières forces pour sceller le portail digital. Il est révélé qu’Oikawa est possédé par une force maléfique, une que BlackWarGreymon reconnaît mais qu’il est incapable d’identifier.
