In the year 2020, Echo and her surviving Dollhouse crew attempt to restore order to a devastating future world before mankind is eliminated.
2020. Topher a éliminé la possibilité de créer une empreinte à distance, mais les gens n’ont pas pour autant récupéré leur propre identité. Les survivants luttent donc pour survivre dans ce monde dévasté. Il existe une solution, mais pour cela, il faut retourner à la maison.
2020-ban járunk, a felülíró technika elszabadult, az emberiség egyik fele gyilkolja a többieket. Echo és a Babház menekültjei létrehozták a Menedéket, ahol nem kell félniük a felülírástól. Miután Meg és Zone, két Los Angeles-i túlélő egy kislányba töltik Caroline személyiségét, s elindulnak a Menedék felé. Azonban foglyul ejtik és Neuropolisz börtönébe zárják őket, ahol találkoznak Echóval és Ballarddal.
Anno 2020. Zone, Mag e Iris/Caroline stanno ancora cercando il Porto Sicuro, ma vengono catturati dalla Rossum. Qui però incontrano Echo e Paul, venuti per liberare Topher (costretto a lavorare su nuove tecnologie a seconda degli scopi della Rossum). Il gruppo, dopo essere fuggito, raggiunge il Porto Sicuro, ossia un luogo isolato da ogni tipo di telecomunicazione, in cui vivono anche Adelle, Pryia e il figlioletto. Sembra che Topher abbia scoperto il modo per far tornare il mondo come prima, resettando tutti gli imprint effettuati, ma per farlo ha bisogno delle tecnologia di una Dollhouse. Aiutati da Anthony e dalla sua squadra, tornano a Los Angeles dove, nel tentativo di nascondersi sottoterra, ingaggiano una battaglia contro i Macellai: Meg rimane ferita alle gambe e Paul, rimasto con Zone indietro per aiutarla, viene ucciso da una pallottola. Arrivati alla Dollhouse, il gruppo scopre che è tornata in funzione e al suo vertice c'è proprio Alpha, ora dedito a cercare un modo per aiutare la gente. Topher costruisce la "bomba" che resetterà gli imprint di tutti gli umani, e decide di sacrificarsi per attivarla, affidando ad Adelle il compito di guidare la gente che si risveglierà verso un futuro migliore. Caroline decide di sacrificare la sua personalità per ridare quella originale alla bambina, dopotutto, lei vivrà ancora in Echo. Zone decide di accompagnarla, mentre Mag è costretta a rimanere alla Dollhouse a causa delle ferite. Alpha se ne va, lasciando ad Echo il compito di distruggere la tecnologia della Dollhouse. Priya presenta Anthony al figlio, e i tre cominciano finalmente la vita tanto sognata. Adelle, Caroline, Zone e il resto delle Doll si recano all'esterno e Topher attiva il congegno sacrificandosi: tutte le doll si risvegliano con le personalità originarie e Zone si presenta alla bambina. Echo, nella Dollhouse, usa per l'ultima volta la sedia di Thoper: come regalo finale, Alpha ha lasciato ad Echo la possibilità di imprintarsi la personal
Кэролайн в теле маленькой девочки и двое выживших по пути к убежищу пойманы солдатами Россума в Нейрополисе. Среди пленных оказываются Эко и Баллард, которые быстро всех вызволяют, выкрадывают сошедшего с ума Тофера и доставляяют всех в убежище. Дождавшись Энтони с его отрядом «перепрошитых», команда направляется в Лос-Анджелеский Кукольный дом, чтобы Тофер мог завершить свое устройство, отменяющее очистку всех кукол планеты. Баллард погибает в перестрелке. Альфа защищал Кукольный дом и стер кукол-мясников, что были в нем. Тофер в офисе Адель вручную активирует свое устройство-бомбу и, погибнув, возвращает всем куклам их истинные личности.
En el año 2020, Echo y los supervivientes de Dollhouse intentan recuperar el orden de un futuro catastrófico antes que la humanidad sea eliminada.