倒産の危機に瀕していた龍山高校へ倒産処理をするために弁護士の桜木建二（阿部寛）がやって来た。しかし、弁護士としての経歴に疑問を持たれ…。
東大進学を目的とした特別進学クラス設置をぶちあげた桜木（阿部寛）。龍山高校から1年間で東大合格者を5人出し、超進学校として生まれ変わることを宣言するが…。
桜木（阿部寛）の元、いよいよ動き出した特別進学クラスは10日間の合宿に入る。桜木は「数学とはある意味スポーツ！たとえば、卓球！」と素手で卓球の構えを取る。
特別進学クラスの強化合宿、伝説の数学教師・柳鉄之介（品川徹）が教壇に立つことに。柳は常にビリの人間には“バカ”と書かれた鉢巻きを巻くことを義務付ける。
特進クラスの生徒・英喜（小池徹平）が、傷害事件を起こし警察に連行される。桜木（阿部寛）と真々子（長谷川京子）も駆けつけるが、警察は英喜の犯行と断定する。
東大英語の専門家・川口(金田明夫)が特進クラスの教壇に。英語の上達法は「英語を恥ずかしがらずに話すこと」と「恋をすること」と、川口はラジカセを取り出し踊り始めた。
東大の模擬試験が迫る中、特進クラスがテレビ番組で取り上げられることになった。生徒のペースが乱れると桜木（阿部寛）は取材に反対するが…。
初めての東大模試に臨んだ特進クラスの6人。試験を終え高校に帰ると教室には桜木（阿部寛）以下、講師たちが待ち構えて、早速、各教科の答えあわせを始めるが…。
二学期が始まった。桜木（阿部寛）は保護者たちに「受験生を持つ家庭の心得」を説くが意見が対立。果たして、桜木は保護者を説得することが出来るのか？
直美(長澤まさみ)の母・悠子(美保純)が脳梗塞で入院してしまい、直美が東大受験をやめると言い出した。特進クラスの残る5人は看病などを皆で交代で手伝うというのだが…。
6人は全員、センター試験を突破。そして本番の2次試験を前に、桜木は「ひとつだけおまえたちに言っておきたい」と鉢巻きを取り出し、最後の授業を始める…。
かつて､落ちこぼれだった龍山高校から東京大学合格者を輩出し､一躍時の人となった元暴走族の弁護士･桜木建二(阿部寛)｡その後､法律事務所を設立し､学校再建のエキスパートとして順風満帆な弁護士人生を歩んでいた｡時は令和｡偏差値32で経営破綻寸前の龍海学園で､教頭･高原浩之(及川光博)が桜木による再建案を提案する｡しかし､自由な校風を理想に掲げる理事長･龍野久美子(江口のりこ)は進学校化に反対し､意見が割れていた｡果たして､桜木と彼の元教え子であり法律事務所で一緒に働く弁護士の水野直美(長澤まさみ)は東大合格者を出し､学園を再建できるのか…?そして彼らを待ち受けるのは､将来に不安を抱え姉と2人で両親が残したラーメン屋を手伝う瀬戸輝(高橋海人)､何をやっても長続きしない今どき女子高生の早瀬菜緒(南沙良)､バドミントンのトップ選手の岩崎楓(平手友梨奈)など､それぞれの悩みや問題を抱えた龍海の生徒たち｡桜木や水野と出会うことで､彼らの運命は大きく動き出そうとしていた…｡
龍海学園に東大進学を目指す特別クラス･東大専科が設立された｡専科の設立も桜木(阿部寛)のやり方も気に入らない理事長の久美子(江口のりこ)は､桜木にこれ以上問題を起こさせないよう､教頭の高原(及川光博)に釘を刺す｡バドミントン部員の楓(平手友梨奈)は､大学推薦をかけた大事な大会を前に追い詰められていた｡調子の上がらない原因は､コンビニでの万引きを桜木に見られたことだ｡そんな楓に桜木は｢お前に大会は無理だ｣とだけ告げる｡一方､東大専科には､弟に劣等感を持つ天野晃一郎(加藤清史郎)に続き､飽きっぽい自分を変えたいと思う菜緒(南沙良)もやってくる｡水野(長澤まさみ)は2人の加入を喜び､さっそく学力テストを行うのだが…｡
東大合格者を見送るシンボルとして､桜木(阿部寛)が校庭に桜の木を植えた｡龍海学園の龍をとって｢ドラゴン桜｣だ｡そんな中､東大専科には天野(加藤清史郎)､菜緒(南沙良)､楓(平手友梨奈)に続いて､偏差値が学年最下位の瀬戸(高橋海人)も加わった｡水野(長澤まさみ)は早速ミニテストを行うが､中学レベルの問題にも苦戦する専科メンバーに､桜木はSNSを活用した勉強法を打ち出す｡一方､理事長の久美子(江口のりこ)は専科に生徒が集まり始めたことに焦っていた｡もしも東大合格者が5人出たら辞任しなければならない｡早めに専科をつぶそうと､対抗する難関大コースを新設し､理系トップの秀才･藤井遼(鈴鹿央士)を引き入れる｡東大専科を見下す藤井に､桜木は｢お前に東大は無理だ｣と断言｡反発した藤井は東大の過去問を使った｢東大専科｣対｢難関大コース｣での勝負をもちかけ､負けた方のクラスは即廃止!存続を賭けた勝負は3週間後｡果たして､その行方は…!?
瀬戸(高橋海人)が学校を休んで3日｡水野(長澤まさみ)や東大専科の仲間は心配するが､桜木(阿部寛)は勉強に集中するように告げ､ITを活用した勉強法を伝授する｡一方､専科に負けて難関大コースを廃止した理事長の久美子(江口のりこ)は､新たに一流大コースを設立｡理系トップの藤井(鈴鹿央士)を再び取り込んで専科に対抗心を燃やしていた｡瀬戸のことが気になる菜緒(南沙良)と楓(平手友梨奈)と天野(加藤清史郎)が学校帰りに｢ラーメン瀬戸屋｣に立ち寄るも､瀬戸に冷たくあしらわれる｡闇金から店への嫌がらせを隠そうとする瀬戸だが､そんな窮状を桜木と水野に知られてしまう…｡そんな中､菜緒と天野は東大を目指して勉強していることが母親にバレる｡抗議にやってきた2人の母親に､桜木は｢受験生の家庭の10カ条｣を打ち出し､さらにある伝説の特別講師を呼んでいた…｡
東大専科では桜木(阿部寛)が招いた特別講師･柳鉄之介(品川徹)による数学のスパルタ授業が行われていた｡一方､専科の生徒との勝負に負けた藤井(鈴鹿央士)は､いら立っていた｡1人追い詰められ､殺気立った様子の藤井を案じた理事長の久美子(江口のりこ)は､東大専科と一流大学コースで再度勝負することを桜木に提案する｡勝負は2週間後｡国語､数学､英語の3教科を大学入学共通テスト形式で行うことが決まった｡負けた方のクラスは即廃止｡水野(長澤まさみ)は実力の差があり過ぎると訴え､高原(及川光博)も専科にハンデを提案するが､桜木は｢その必要はない｣と言い切る｡桜木が藤井に対抗する新たな勉強法として打ち出したのは､まさかの"ゲーム"!?そして､東大専科に5人目の生徒がやってくる…｡
東大専科は3日間の勉強合宿を行うことになった｡桜木(阿部寛)が声をかけた小杉麻里(志田彩良)も原健太(細田佳央太)の付き添いとして参加し､勝負に破れた藤井(鈴鹿央士)も約束通りやってきた｡合宿初日､16年前に地獄の合宿で飛躍的に成長した経験をもつ水野(長澤まさみ)は､地獄のカリキュラムを発表する｡しかし､桜木が発表したカリキュラムは驚くべきものだった!そして､受験に挑むために最適な食事､運動､生活習慣などあらゆるメソッドを駆使し､令和の合宿に挑む一同｡藤井､麻里の存在が東大専科に与える影響とは…｡また､さらなるレベルアップを目指し､桜木はくせ者の国語講師を招へいする｡東大合格に向けて着実に前進しているかにみえる彼らだが､不穏な空気がただよっていた…｡
東大専科の7人が東大模試を受けることになった｡模試で合格の見込みがないと判断された者は､専科をやめなければならない｡今の学力では､何人かは最低のE判定になることは明白だ｡桜木(阿部寛)が出したあまりに高いハードルに､生徒たちは混乱し､水野(長澤まさみ)も不安に襲われる｡模試に備え､新たに桜木が招へいした英語の特別講師によるリスニング力強化のための驚くべき勉強法が始まる｡さらに桜木は､模試に役立つ｢東大模試6カ条｣を授けるが､菜緒(南沙良)と天野(加藤清史郎)は､焦りから追い詰められていた｡模試当日､プレッシャーに押しつぶされそうな7人は､それぞれの思いを胸に会場へ向かう｡一方､龍海学園では先代理事長･龍野恭二郎(木場勝己)が､何やら新たな動きを見せていた…｡
東大合格者が5人出たら学園は売却される…｡桜木(阿部寛)宛に送られてきたファイルから､先代理事長･恭二郎(木場勝己)による久美子(江口のりこ)の理事長退任と学園売却計画が発覚｡そして､その背後には不穏な動きも…｡最大の危機に見舞われる一方で､桜木は生徒7人にオーダーメイドの勉強法を伝授する｡それぞれの学力を考慮した受験科類と選択科目の提案､それに合わせた攻略法だ｡また､水野(長澤まさみ)からは夏休みを前に変わった対策法が伝授される｡そんな中､楓(平手友梨奈)は1人悩んでいた｡桜木は､その様子に気づくが…アクシデントが楓を襲う｡さらに､桜木の前に意外な人物が現れ…｡
大学入学共通テストまでのカウントダウンが始まった｡今までに招へいした特別講師陣たちと試験に向け追い込みに入っている生徒たちに､桜木(阿部寛)は､いよいよ共通テストの出願書を渡す｡そこで決意の表情を見せる専科メンバーに､桜木は｢共通テストの心構え5カ条｣を授ける｡そして迎える共通テスト本番｡これまで6回の模試を乗り越えてきた瀬戸(高橋海人)をはじめとする､東大専科の生徒たちに決戦の時が来た｡しかし､彼らをただならぬ緊張とプレッシャーが襲う｡共通テストを終えた瀬戸に襲いかかる試練…藤井(鈴鹿央士)の決断とは!?一方､水野(長澤まさみ)は弁護士として､学園の売却を阻止する方法を必死に探っていた｡学園の先代と直接対決を迎える桜木たち｡さらに､桜木･水野に襲いかかる驚がくの真実が…｡
2次試験が迫る中､桜木(阿部寛)は､ますます厳しい状況に追い込まれていた｡学園買収には教頭の高原(及川光博)が関わり､坂本智之(林遣都)と米山圭太(佐野勇斗)も加担していた｡水野(長澤まさみ)は心を痛め､久美子(江口のりこ)は｢生徒たちのために奇跡を起こして｣と桜木に頼む｡一方､共通テストで思うような点数が取れなかった藤井(鈴鹿央士)は､ある決意を桜木に伝える｡専科から離脱した瀬戸(高橋海人)は…｡そんな中､2次試験に向けてラストスパートに突入する東大専科｡生徒たちは､最後の追い込みで東大の過去問を必死にやり遂げる｡そんな生徒たちに桜木が用意した大逆転の秘策とは?果たして､結果は?そして､龍海学園の行く末は…?
