時は幕末、場所は長崎。近隣の不良たちを喧嘩で次々と倒し、今や敵なしの強さを誇る慶一郎。だが、天下一の男を目指す慶一郎にとって、長崎統一など虚しいだけであった。そんな日々を送る慶一郎に殺人事件の容疑がかかる。その影には謎の美女がいて……!?
童貞の呪いのせいで女の子とは触れ合えない慶一郎は、ストレス解消と出会いを求めて弟分の百助と街に繰り出す。とある茶屋でちはるという女の子に出会うのだが、実は妖狐であり、人間ではないちはるの正体を巡るトラブルに、慶一郎と百助は巻き込まれてしまう。
慶一郎の周囲に幾度か現われた法光院という謎の女が、クグツを操り慶一郎に襲いかかってきた。慶一郎しか動かせない鬼神・スサノオの力を知りたい法光院の攻撃により、窮地に陥る慶一郎。上手く操縦できない慶一郎のピンチを救ったのは意外な人物で……？
街でナンパに繰り出した慶一郎だが、旅の侍との喧嘩になってしまう。男だと思っていたその侍は、男装していた女性の浅井兵庫であった。空腹で倒れた兵庫はお冨に救われて、慶一郎のいる桜湯で働くことになるのだが、彼女の旅には果たさねばならぬ目的があった。
童貞の呪いが解ける方法は、生娘との接吻しかないと聞いた慶一郎は、霧子やちはるたちに接吻を迫る。しかし、相手の気持を無視した行動に逆に険悪な雰囲気になってしまう。そんな最中、童貞の呪いに隠された秘密を、お冨は霧子に語り出すのだった。
慶一郎と同じように鬼神を操ることのできる一ツ橋重義。彼こそ17年前に日本にやってきた黒船を焼き払い、徳川の体制を護った英雄であった。現在はほかの有力者に疎まれ、半ば幽閉されている重義だが、徳川幕府の腐敗を前にある計画を実行に移す。
呪いが解けたことを知った慶一郎は、百助とあいも変わらず街に繰り出していく。それを知った霧子とちはるは2人を追い詰めるが、そこへ霧子迎えに来たという霧子の幼なじみ、捨丸が現れる。捨丸の登場にやきもきする慶一郎。そんな最中、強敵・新撰組の強襲が！
坂本龍馬、グラバー、フルベッキたちによりスサノオを起動させるための印籠を盗まれてしまう慶一郎。印籠を取り戻すために、龍馬達に挑んだ慶一郎を待っていたのは、現代でいうところの野球拳で……!? すべてを賭けたジャンケン勝負が始まる！
龍馬との問題も片付き、いい感じの雰囲気になる慶一郎と霧子。しかし、ちはるや兵庫と違い、慶一郎とともにスサノオに乗れないことに悩んでいた。そんな霧子の目の前に、法光院が現れて、霧子の悩みを聞いてくれるのだが、法光院の目的は別にあったのだった。
暴走したスサノオのせいで、崩壊した桜湯と意識不明となってしまった慶一郎。スサノオの暴走を霧子のせいではないかと問い詰めるちはる。自らの責任と慶一郎への心配などの気持ちをかかえた霧子は、さまよった先の港で坂本龍馬と出会う。
フルベッキ、グラバーによって再度日本へ襲い来る黒船。浦賀の際とは比べ物にならない多数の黒船により、危機を迎える長崎。その黒船を一撃のもとに葬り去ったのは、一ツ橋重義の駆る鬼神・タケミカズチであった。その圧倒的な力に、慶一郎は立ち向かうが…!?
霧子をさらわれ、ボロボロに傷つきながらもタケミカズチとの最終決戦に向かう慶一郎とスサノオ。果たして慶一郎は霧子を取り戻し、一ツ橋重義に打ち勝つことができるのか!? そして、鬼神とはいったいなんなのか……!? いよいよ最後の大一番の幕が開く!!
