정신을 잃었다 깨어난 지오. 주변엔 정체 모를 남자들이 쓰러져 있고, 자신의 몸 여기저기 다친 상처가 가득하다. 지오는 자신이 누구인지, 무슨 일이 일어난 건지 아무것도 기억하지 못하고, 그때 지오에게 칼을 든 의문의 남자가 다가오는데... 한편, 오랜 시간 부모의 실종사건을 조사하던 구름은 주요 단서였던 남자가 시체로 발견되자 크게 좌절한다.
추락 사고로 심각한 부상을 당한 지오는 죽을 위기에 처하고, 병원에서 깨어난 구름은 어린 시절 만났던 아이에 대한 기억이 떠올라 혼란스럽다. 구름은 모든 게 베일에 싸여있는 지오에 대해 조사하기 시작한다. 이손은 지오를 납치하기 위해 병원으로 향하는데...
지오는 부상당한 구름이를 구해서 어디론가 데려가고, 이손은 지오를 놓친 일로 크게 문책 당한다. 구름은 지오에게 자신의 부모에 대해 묻지만 지오는 전혀 기억하지 못하고, 지오의 기억을 찾기 위해 어린 시절 지오가 지냈던 곳으로 향한다. 그리고 그곳에서 뜻밖의 얘기를 듣게 되는데...
보육원에 불을 낸 사람이 자신이었다는 것을 기억하고 크게 충격을 받은 지오. 구름이는 그런 지오를 오교수에게 데려가고, 지오는 스스로에 대해 알기 위해 오교수의 검사를 받기로 한다. 하지만 검사 도중 또 다시 끔찍한 기억이 떠오른 지오. 구름에게서 도망쳐 옛 친구를 찾아가는데...
구름이는 갈 곳도, 기댈 수 있는 사람도 없는 지오를 자신의 집으로 데려온다. 그곳에서 지오는 구름이가 부모를 찾는 일에 얼마나 절박한지, 그 동안 혼자 얼마나 외로웠는지 이해하게 된다. 한편 또다시 지오를 놓친 이손은 위험한 선택을 감행하는데...
어린 시절 자신이 지냈던 연구소로 끌려간 지오. 그곳에서 지오는 뜻밖의 인물과 조우한다. 그리고 그에게서 충격적인 진실을 듣게 되는데... 한편, 구름은 부모님의 실종 사건의 실마리를 찾고 다시금 수사에 박차를 가한다. 사건의 단서를 따라가던 그녀가 다다른 곳은?
아수라장이 된 연구소에서 구름과 다시 만나게 된 지오 구름의 만류에도 지오는 이손(김성오)과의 싸움 도중 결국 폭주하고 그 과정에서 구름이 크게 다치게 된다. 구름을 병원으로 데려간 지오는 자책하며 구름의 곁을 지킨다. 한편, 연구소를 잃은 류중권과 김철수, 황정아 사이에 조금씩 균열이 생기는데...
구름을 지키기 위해 지오는 과거 그가 숨어 지냈던 목장으로 향한다. 지오는 그곳에서 구름과 함께 있음에 처음으로 평범한 사람의 행복을 느낀다. 하지만, 구름은 평생 도망자로 살기보다는 위험하더라도 자신이 있던 곳으로 돌아가겠다고 한다.
아기와 함께 끌려간 곳에서 구름은 최팀장을 만나고 그로부터 믿을 수 없는 이야기를 듣게 된다. 최팀장이 전한 이야기에 엄청난 혼란에 빠지는 구름. 한편 지오는 구름이를 찾기 위해 최팀장의 뒤를 쫓기 시작한다.
자신 때문에 친구 원이마저 위험에 처하자 지오는 절망하고, 구름과 아이를 찾는 일에 더더욱 절박해진 지오는 어떠한 위험도 감수하려고 한다. 한편, 구름이 잡혀있던 호텔에 괴한들이 습격해 오고 구름은 아이를 지키기 위해 그들과 맞서는데...
자신에게 환호하는 사람들의 모습에 허탈감을 느끼는 지오. 이제 지오는 구름과 아이를 위해서 기꺼이 선을 넘고자 한다. 구름은 그런 지오를 되돌리려 하고, 둘의 마음은 엇갈리기만 한다. 한편, 궁지에 몰린 김철수는 마지막 반격을 위한 계획을 세운다.
구름이와 아기를 위해 새로운 세상을 꿈꾸는 지오. 지오가 예전 인간다웠던 지오로 돌아가길 바라는 구름. 서로를 위해 다른 길을 선택한 두 사람은 다시 만날 수 있을까?
