Una coppia di bagnanti, durante un giro in motoscafo sul lago di Hamanaka, vengono terrorizzati da un terribile mostro che li mette in fuga. Le autorità vengono subito allertate ma le ricognizioni non portano alcun frutto.
Boss, recatosi nottetempo al lago per perscare con Nuke e Mucha, vede personalmente il mostro gigante ma quando corre ad avvisare Koji, il ragazzo lo deride prendendolo per un credulone che si beve le storie sulle leggende del lago.
Shiro però decide di credere alla banda di Boss e insieme tornano tutti e quattro al lago decisi a compiere un ulteriore sopralluogo. I ragazzi, durante l'escursione in barca, vengono sorpresi dal mostro dalle sembianze di una balena che li inghiotte nella sua pancia ad eccezione di Boss. Fortunatamente Shiro riesce ad dare l'allarme e Koji e Sayaka si fiondano subito presso la zona del lago.
I due incontrano una vecchia megera che vaneggia di una maledizione, affermando di poter controllare il mostro. Sayaka, durante un corpo a corpo con la strega, finisce in acqua e viene inghiottita dal mostro. Il professor Yumi, giunto sul posto, spiega a Koji che esistono cinque laghi nella zona e che probabilmente sono legati da passaggi sotterranei, il che spiegherebbe le improvvise sparizioni del mostro. Koji, a bordo del Mazinga, bracca il nemico lungo i tunnel segreti. Quando la balena meccanica viene catturata la megera si rivela di nuovo: si tratta del barone Ashura che minaccia Koji di uccidere gli ostaggi e l'eroe deve cedere, nonostante abbia scoperto che il nemico sta raccogliendo uranio per realizzare un ordigno per il dottor Inferno.
Il mostro lascia la zona di battaglia ma Sayaka e gli altri riescono a fuggire dalla pancia del mostro. Mazinga a questo punto può combattere senza remore: dopo una langa e sofferta battaglia aerea Koji riesce a trionfare sul mostro e sventare la minaccia atomica del dottor Inferno.
Koji no hace caso cuando Boss y su banda le dicen que vieron a un monstruo en el lago Yamanaka. Sin embargo, puede que verdaderamente haya algo letal en las aguas.
山中湖に不思議な怪獣の正体は、ドクターヘルの作り出した機械獣・グラナダE3だった。そんなことなど露知らぬシローたちは、怪獣を生け捕りにするんだとボートで湖に漕ぎ出し、グラナダE3に呑み込まれてしまう。グラナダE3の体内は原子炉になっていた。湖底に露出したウラン鉱石を食べ、プルトニウムを蓄積させて核エネルギーに変えようとしていたのだ。そのエネルギーは、既にマジンガーZを破壊するまでの量に達していた。
