Die A-Laws beginnen nach Piloten zu suchen, die Kampf-Erfahrung mit Gundams haben. Trotz der Zweifel, die Kati und Soma an der Organisation und ihren neuen Positionen hegen, versprechen sie Sergei alle geheimen Informationen zukommen zu lassen.
After entrusting Lyle Dylandy with top secret information pertaining to Celestial Being's activities, Setsuna goes to confront Sumeragi Lee Noriega who, consummed by guilt over the countless lives lost during the organization's military interventions four years prior, found refuge in Bill Katagiri and worsened her drinking condition. Meanwhile, Wan Liu Mei leaks information to Ribbons and Saji Crossroad is given access to Celestial Being's archives and learns about the existence of the Throne Gundams. A-LAWS forces mount an attack on Celestial Being's ship, the location of which was among the data acquired by Ribbons, and Tiera is left alone to defend the Ptolemaios. Setsuna, accompanied by Lyle and Sumeragi, heads towards the ship and boards the 00 Gundam, easily dispatching the attacking units and saving the Ptolemaios.
Setsuna, de retour parmi Celestial Being, décide d'aller recruter un nouveau « Lockon Stratos ». Il s'agit du frère jumeau de Neil Dylandy, Lyle. Il profite de son passage pour forcer Sumeragi Lee Noriega à retourner sur le Ptolémée, où ils essaient de mettre en place un nouveau système sur le Gundam 0.
ＣＢへの参加をライルに促す刹那。一方、アロウズのホーマー・カタギリ司令は、ガンダムの再来に、カティ、ピーリス、アンドレイなどをアロウズへと召集する。さらにそこには仮面の男、ミスター・ブシドーこと、グラハムの姿もあった。そして沙慈は、ルイスを襲ったガンダムは、刹那たちとは別部隊であったことを知る。
２年間、ビリー・カタギリの家にいたスメラギの元に訪ずれた刹那は、スメラギの素性を明かし、その場からスメラギを連れ去る。二人は宇宙でライルと合流するが、カタロン構成員でもあるライルは、クラウスたちにＣＢに潜入することを告げていた。
プトレマイオスへと向かう刹那たち。しかし、グッドマンの率いる部隊がプトレマイオスへと迫っていた。ダブルオーを起動させた刹那は、アロウズのＭＳ小隊を一掃する。その様子を見ていたリボンズは、ダブルオーの性能に歯噛みするのだった。
外交中、嫌疑をかけられ、アロウズの保安局員に捕まってしまったマリナ。収監施設には４年前、連邦軍に逮捕されたアレルヤも拘束されていた。
得知莱尔是卡达鲁成员的刹那，对莱尔表示若他有改变世界的意思，就加入天上人。另一方面，A-LAWS军本部也因为敢达再度出现而显得慌张。卡蒂．马涅钦、安德列等人接连受到荷马‧片桐司令徵召。此外还出现了神祕的面具男子身影。
