After a trip to the Mendel Colony, Lacus and the Eternal's location is discovered by ZAFT. Just when it looks bleak for the Eternal, Kira comes to the rescue...
Sur Mendel, Da Costa trouve des notes sur le plan Destiny de Gilbert Durandal, qu’il ramène à Lacus et le commandant Waldfeld. Néanmoins, l’Eternal se fera repérer et devra appareiller plus tôt que prévu, au grand dam de Kira, encore sur Terre et impuissant…
ヘブンズゲートは、ザフトによって完全に制圧された。が、ジブリールの行方は未だに不明のまま。デュランダルは、その足取りを追うよう軍に命じる。 その頃オーブのオノゴロ島では、傷ついたアークエンジェルがドックに入っていた。クルーたちが修理に追われる中、フリーダムという力を失い、一人焦るキラ。マリューは、 そんなキラに優しく声を掛け、励ます。ようやく意識を取り戻したアスランも、久しぶりにカガリと言葉を交わしていた。
一方、ラクスの指示を受けたダコスタは、かつて遺伝子研究所のあったコロニー・メンデルの中を調査していた。全てのデータが廃棄された中、唯一残されていたノート……そ の中に「デスティニープラン」なる記述を目にしたラクスは、思わず息をのむ。と、そのときエターナルの艦内警報が！ ザフトに発見されてしまったラクスたちは、証拠のノートとあるモノをキラたちへ届けるため、決死の強行突破を試みる。エターナルのピンチを知ったキラは、ストライクに急遽ブースターを取り付けると、単身宇宙へ。間一髪救われたラクスは、キラへ新たな力・ストライクフリーダムを手渡すのだった。
达科斯塔受托前往L4殖民卫星门德尔的废弃研究所中寻找资料，无意中发现了当年还是一介研究员的杜朗达尔所提出的“命运计划”。天堂基地投降后，LOGOS成员全部被抓了起来，惟有事先悄悄逃走的加百列独自前往了奥布，在那里有和他关系密切的塞兰家族；另一方面，在大天使号上，身体逐渐复苏的阿斯兰和卡嘉莉坦陈了各自的心情，相互间的裂痕也逐渐在弥合。
Хевенсгейт был полностью захвачен Зафтом. Однако местонахождение Джибрил по-прежнему неизвестно. Дюрандаль приказывает войскам проследить его след.Тем временем на острове Оногоро в Орбе повреждённый Арк-Энджел находился в доке. Пока экипаж был погружён в ремонт, Кира, лишившийся силы Фридом, метался и переживал в одиночестве. Марью нежно заговорила с ним и приободрила. Наконец пришедший в себя Аслан также после длительного перерыва обменялся словами с Кагари.По указанию Лакс Дакоста проводит расследование в колонии Мендель, где когда-то находилась генетическая лаборатория. Все данные были уничтожены, и лишь одна тетрадь уцелела — в ней Лакс обнаруживает запись о Дестини-плане и невольно замирает. В этот момент на Этернал срабатывает бортовая тревога: Лакс и её люди замечены Зафтом. Чтобы доставить Киру доказательства — тетрадь и один предмет, — они решают пробиться ценой жизни. Узнав о бедственном положении Этернал, Кира торопливо…
