The Minerva engages Neo and the 3 stolen Gundams in a battle over the Indian Ocean.
Le Minerva est dépéché dans les eaux de l'Océan Indien, où les forces terriennes ont commencé à établir une base faisant rempart à Carpentaria.
Arrivé là-bas, le vaisseau est attaqué par une trentaine de Windams ainsi que Chaos et Abyss. Le Minerva ne parvient pourtant pas à localiser la base d'où ces derniers ont décollé.
Pendant son affrontement avec Néo, Shinn se laisse emporter par la rage de combattre et s'éloigne du vaisseau-mère. Il parvient accidentellement à localiser la base des forces terriennes.
La Minerva ingaggia Neo ei 3 rubati Gundam in una battaglia sull'Oceano Indiano.
カーペンタリアを出発したミネルバは、潜水艦・デグチャレフと共にジブラルタルへ向かった。その頃ネオは、そこから程近い半島で密かに地球軍基地建設の任に就いていた部隊から、ウィンダム大部隊を借り受けていた。援軍を得たネオは、スティングと共にミネルバを襲撃する。迎え撃つ、アスランとシン。だが、それはネオの巧みな陽動作戦だった。水中深く潜行していたアビスガンダムが、ミネルバの目前に迫る。
その頃シンは、突如海岸線から現れたガイアガンダムを追って戦線から離れ、基地建設予定地に辿り着いてしまう。そこでは、基地建設のために借り出された現地の民間人たちが、強制労働させられていた。その光景を見たシンは、逆上する。
慣れない水中戦に戸惑うレイとルナマリアのザクを尻目に、アウルはデグチャレフを一撃のもとに轟沈させてのけた。怒りに燃えるシンは、基地施設や戦闘車両を次々と破壊する……民間人たちを解放するためとはいえ、それはある意味一方的な虐殺であった。
アスランはシンを平手打ちし、「自分だけで勝手な判断を下すな！ 力を持つ者なら、その力自覚しろ！」と怒鳴りつける。シンの瞳には、反抗的な光が宿っていた。
尼奥调集了附近地球联合军据点的MS，并亲自驾驶温达姆带队对密涅瓦号一行展开了攻击。密涅瓦号被迫迎战，阿斯兰决定与真一同出击，并被塔丽亚委以MS部队指挥的重任；而雷和露娜玛丽亚则在舰上待机。 驾驶混沌高达的斯汀·奥克雷选择了阿斯兰驾驶的救世主高达作为对手；尼奥则带队围攻在奥布突围一战中大出风头的真。 与此同时，奥尔·尼达驾驶深渊高达在水中对ZAFT军进行了突袭。面对强大的对手，虽然有数量上的优势，但尼拉贡戈号上的ZAFT军水中用MS格恩却毫无还手之力。待机中的雷和露娜玛丽亚不得不在机体加装水中战装备后出击。 看到激烈的战况，担心尼奥安危的史黛拉也加入了战团，与真战在了一起。由于数量上的优势，联合军占据了上风，而此时的真却无视阿斯兰的退后命令，执意要与盖娅高达分出胜负。在和斯特拉的激斗中，真无意中发现已来到了联合军正在建设中的据点。此时联合军士兵正在枪杀试图趁乱逃跑的平民，这一幕勾起真心底惨痛的回忆。 发现部队损伤严重、而且联合军据点也被侵入之后，尼奥决定撤退。在联合军撤退前，ZAFT军的尼拉贡戈号被奥尔·尼达击沉。 真不顾阿斯兰的阻止，执意毁坏了联合军的据点，救出了被羁押的民众。归舰后，即使被阿斯兰打了耳光，真仍然不认为自己做错了。 “拥有能力的人更应该自觉！”阿斯兰如此回答。
