Genki sitzt in der Schule und träumt von seinem Lieblingsspiel Monster Rancher. Zuhause angekommen sieht er zuerst nach, ob die neue Ausgabe von Monster Rancher schon da ist. Voller Freude, dass das Spiel angekommen ist, fängt er an zu spielen. Plötzlich wird er in die Welt von Monster Rancher versetzt. Suezo und Holly wollen mit Hilfe eines Geheimnissteins den Phönix erscheinen lassen, doch statt dessen taucht Genki auf. Doch dann erscheinen aus dem Nichts böse Raub-Dinos, um den Stein zu stehlen, doch Genki kann Suezo und Holly vor den bösartigen Viechern retten. Noch einmal versuchen sie, Phönix erscheinen zu lassen, doch nun erscheint ein kleines Monster. Genki findet den Kleinen sofort süß. Als die Raubdinos noch einmal auftauchen und den Kleinen mitnehmen wollen, versucht Genki ihn zu retten. Der Kleine will bei Genki bleiben und vertreibt mit seinem lauten Geschrei die Dinos. Genki und das kleine Monster werden Freunde, und als Genki auch noch einem Namen für ihn findet, ist "Mocchi" glücklich. Zusammen mit Holly und Suezo macht Genki sich auf die Suche nach Geheimnissteinen, um den Phönix zu finden.
Genki is a young boy with an ordinary, dull life. That is, until he gets a new game in the mail. He soon gets pulled in and must now fend for himself within the game. He soon comes across two friends, Suezo and Holly. But, will they be able to stop the terrible monster, Moo?
Genki es un niño pequeño con una vida ordinaria y aburrida. Es decir, hasta que reciba un nuevo juego por correo. Pronto es arrastrado y ahora debe valerse por sí mismo dentro del juego. Pronto se encuentra con dos amigos, Suezo y Holly. Pero, ¿serán capaces de detener al monstruo terrible, Moo?
「モンスター甲子園」で優勝したゲンキは、「モンスターファーム200X」のCD-ROMを入手。ゲンキが早速試すと「モンスターファーム」の世界に召喚されてしまい、この世界が悪の権化・ムーに脅かされていることを知る。