Infrangendo i divieti del Green Lockdown i ragazzi di Nur accedono di nascosto al mare ma le Milizie Verdi li individuano e li arrestano. Quella stessa notte c'è una misteriosa esplosione nella foresta e i genitori di Maria e Jacopo vengono rapiti.
Giorgio, comandante di Nur ed ex di Isa, indaga sulla scomparsa di Isa e Antioco. Dopo una lite, Jacopo scopre gli ultimi movimenti del padre, Giorgio lo salva ma una brutta notizia sconvolge tutti.
L'uomo della stalla viene rilasciato ed emergono sospetti su Isa e Antioco come trafficanti d'ossigeno. Caterina è arrestata, e al funerale Jacopo litiga con Giorgio, ossessionato dal messaggio compromettente di Isa per Maria.
Jacopo è convinto che Isa e Antioco siano stati incastrati e scopre un misterioso albero incappucciato nella foresta, insinuando in Maria un dubbio su Giorgio. Anche gli altri ragazzi sono disposti a tutto per scoprire la verità.
I ragazzi scoprono un indizio su Isa e Antioco nella foresta di Nur, ma i droni delle Milizie li scoprono. Alex e Bea vengono arrestate, mentre gli altri devono vedersela con una terribile tempesta di sabbia in arrivo dal Sahara.
Sotto la tempesta di sabbia i ragazzi rischiano la vita per provare a uscire dalla foresta. Alex e Bea, interrogate dal generale Piras, si lasciano scappare il nome di Maria. All'uscita delle miniere i ragazzi vengono catturati da un gruppo mascherato: i disobbedienti.
I Disobbedienti, guidati da Pietro, danno a Maria un video di Isa che compromette Giorgio e le Milizie. Arturo e Benny cercano i genitori di Alex e Bea, mentre Maria e Jacopo, traditi da Damiana, finiscono nelle mani di Piras.
Jacopo e Maria vengono portati a Porto Flavia per essere giustiziati. Giorgio ed Emma cercano di aiutarli mentre Benny e Arturo smascherano Luisa e fuggono. Piras costringe Damiana a seguire il piano con una minaccia.
Maria porta Jacopo al rifugio dei disobbedienti per curarlo e fa arrestare Giorgio, ritenuto colpevole della morte dei genitori. Damiana, pentita, fa una rivelazione sul padre. Piras prova l'irruzione nel rifugio dei disobbedienti.
I ragazzi e Giorgio tentano di attuare il piano di Jacopo: fermare l'autocombustione degli alberi entrando nella foresta. Arturo e Benny cercano Caterina, mentre Piras raduna i Miliziani per eliminare chiunque li ostacoli.