In the Puzzle of God, Kaito and Raetsel must travel through their pasts and alter them. However, they must be careful not to let the puzzle consume them. If it does, they could spend all eternity wandering the Time Maze!
Como se muestran Kaito y Raetsel su pasado, que el cambio basado en los deseos de sus corazones, se superponen, mostrando una visión de Kaito unirse a Jin y Raetsel en su viaje. Al llegar a un punto en el Jin decide dejar Raetsel detrás y tomar Kaito con él, Raetsel siente insatisfecha y los intentos de cambiar el resultado, repitiendo el mismo bucle sobre sobre Jin le dice que ella es 'falta algo', hasta que se decide rechazar la memoria por completo y terminar en un mundo fabricado en la que nunca conoció a Jin.