ごく普通の中学２年生、月野うさぎは今日も朝寝坊。テレビでは最近多発している宝石泥棒事件を、謎の正義の味方・「セーラーＶ」が解決したというニュースが流れている。セーラーＶに憧れを抱きつつ遅刻ぎりぎりで家を飛び出すうさぎ。登校中、額に三日月模様のある不思議な猫のぬいぐるみが落ちてきた。うさぎが通り過ぎた後怪しく光る額の三日月・・・。 その夜、枕元になんと朝のぬいぐるみが！ 「ルナ」と名乗るその猫は、月野うさぎは月の戦士「セーラームーン」であり、地球で動き出した悪の組織と戦う使命があるのだということを言っている。あまりのことにとても信じられないうさぎ・・・。 翌朝うさぎは呑気にショッピング。そんな時うさぎの親友・なるが、母親が開催する新作ジュエリー発表会の会場で危機に陥っていた！ルナの言っていた悪の組織の妖魔が、なるの母親に取り憑いたのだ。 月の戦士の勘でそれを察知したうさぎは会場へ向かう。そこには一足先にルナが来ていた。携帯アイテムでうさぎを変身させ、二人は警備をかいくぐり会場の中へ。 中はショーの真っ最中。しかしクライマックスにさしかかると、なるの母親が豹変、彼女に取り憑いた妖魔が人々のエナジーを吸い取り始めた。 居合わせたうさぎはセーラームーンに変身。自分の姿に驚き、おっかなびっくりながらも妖魔を倒したセーラームーンだが最後に危険が待ち受けていた。悪の組織・ダークキングダムの配下の一人、ジェダイトが襲ってきたのだ。ふいを突かれたセーラームーンを助けたのは、謎の人物、タキシード仮面だった。
不思議なぬいぐるみ、ルナと出会い「セーラームーン」として悪の組織と戦う決意をした月野うさぎ。しかし普段のうさぎはあまりに緊張感のない普通の中学生。その頼りなさにルナは、早く仲間の戦士を見つけなくてはと必死になっている。 闇の世界で悪が動き出し地球に危機が迫っているこの大変なとき、うさぎの学校はテストの話題で持ちきり。成績の上位者が張り出されたのだ。一位は同じクラスの水野亜美。学年トップの成績の彼女だが、誰ともうち解けようとしないため生徒達からは敬遠されている。お昼休みも独りぼっち。うさぎは少しだけそんな亜美が気になっていた。 その日の帰り道、うさぎは偶然亜美を見かける。なんと彼女が手にしているのはルナ！なぜルナが亜美のところへ？！しかしもっと驚いたのは亜美の様子だ。ぬいぐるみの埃を払い優しく話しかける彼女を見て、うさぎは心から亜美と友達になりたいと思った。「自分に友達ができるかもしれない！」亜美は初めての経験に心をときめかす。 今まで一度だって、好きなアイドルのＭＤを貸してくれたりお弁当を一緒に食べようと誘ってくれた友達がいただろうか。「亜美ちゃん」と呼んでくれるうさぎとの出会いに、亜美の心は期待で高揚するのだった。 その夜ルナから亜美が戦士である事を聞かされたうさぎは大喜びでその事を亜美に話す。しかし亜美の心は複雑。うさぎが自分に優しいのは戦士だからなのだとがっかりし、戦士になりたくないとうさぎに告げる。 しかし思いがけない事件が発生。亜美の通う塾に妖魔が出現し亜美が襲われたのだ。危機一髪で亜美を救ったのはセーラームーン！必死で亜美を助けるうさぎに、亜美は心から「一緒に戦いたい」という気持ちになった。 かくして「セーラーマーキュリー」が誕生。うさぎと亜美は「戦士だから」だけではない本物の友情で結ばれ、共に戦うことを誓い合った。
月野うさぎとルナは遂に一人目の仲間の戦士を見つけだした。なんと、同じクラスの天才・水野亜美。セーラーマーキュリーとして、セーラームーン、そしてまだ見ぬ仲間の戦士達と共に戦う決意をする。 プリンセスと、未知のパワーを持つ「幻の銀水晶」を探し出して悪の手から守ることが、セーラー戦士の果たすべき使命なのだ。一刻も早く残りの戦士を見つけ出したいルナはある人物に目星をつけていた。謎の戦士・セーラーＶ。セーラームーンが目覚める以前から活躍している彼女はプリンセスである可能性さえあるのだ。 そんな頃、世間では少女が行方不明になる事件が多発していた。妖魔の仕業かもしれないと直感したうさぎと亜美は、事件についての調査を始める。気になるのは生徒達の間で囁かれている噂。少女達が次々と姿を消すのはある霊感の強い巫女さんの呪いが原因だというのだ。うさぎと亜美が解決策を模索しているとき、二人は偶然噂の張本人、火川神社の巫女・火野レイと出会うのだった！ 自分の目の前でセーラームーンに変身するうさぎにレイは驚く。セーラームーンは必死で妖魔と戦うがなかなか手強い。その時レイのブレスレットが発光した。なんとレイも戦士だったのだ。セーラーマーズに変身、力を合わせて妖魔を倒した。ところがこれから仲間として協力しようと喜ぶうさぎと亜美に、レイは「仲間になるつもりはない」と冷たく言い放つのだった。
うさぎたちは３人目の戦士・火野レイをついに発見。ところが仲間として戦うつもりはないという彼女。うさぎ、亜美、ルナはレイを説得するため思案に暮れる。ルナにはもう一つ気になることがあった。その知られざるパワーに悪の組織・ダークキングダムからも狙われている「幻の銀水晶」、これを探し出し守ることがセーラー戦士の使命の一つでもあるという貴重な宝石が、名前を変えて近くに存在しているかも知れないのだ。 「幻の青い水晶」と呼ばれるそれは、ある令嬢の誕生パーティーの会場で出席者に披露されるとのこと。うさぎ、亜美、ルナは早速パーティーに潜入する。ところがダークキングダムの使者・ネフライトもこの宝石に目を付け会場に忍び込んでいた。仮装で盛り上がる大パーティー。人の見分けもつかないこの状況で、彼にいち早く妖気を感じたのは何と火野レイ！彼女も「幻の青水晶」に何かを感じパーティーに来ていたのだ。 さらに敵か味方か、タキシード仮面も姿を現す.最初に妖魔を発見したのは亜美とレイだった。令嬢に取り憑いた妖魔はなかなか手強い。そこへパーティーでタキシード仮面にうっとりしていたうさぎが漸く駆けつける。パーティー会場から聞こえる愛野美奈子の歌を頼りに３人でタイミングを合わせ、やっとのことで妖魔を倒すことが出来た。しかし問題の宝石を守ろうとしたうさぎがビルから転落！とっさに彼女の手を掴んだタキシード仮面も一緒に落ちていく。絶体絶命かと思われたがセーラームーンのムーンライトスティックが放った光に助けられる。タキシード仮面が敵か味方か混乱するルナ。一方レイにはうさぎ達との仲間意識が芽生え始めていた。
生まれて初めてできた友達、うさぎ・レイの存在に幸せを噛みしめる亜美。 しかし同時に二人を失うのが怖い。「本当の友達になれる本」のマニュアル通りに二人に接してなんとかうち解けようとする。 「月野さん」を「うさぎ」と呼び、苦手なカラオケも歌う。 無理をする度にこぶしを握りしめる亜美。ついには極度の緊張で倒れてしまった。 そんな時ルナから情報が入る。「幻の銀水晶」であるかもしれない宝石が見つかったというのだ。うさぎたちが駆けつけた先には「学生活け花展」の看板。ここの講師の胸に光るペンダントが怪しいという。 当然会場では「幻の銀水晶」を狙うダークキングダムの妖魔との戦いが待っている。 うさぎたちとの友情が心に引っかかる亜美。手強い敵を相手にマーキュリーパワーは発揮できるのか. うさぎたちとは別行動で会場に潜入した亜美は一人で妖魔と戦うことに。しかし一人の力ではなかなか敵を倒すことが出来ない。助けを呼びたいがうさぎたちとの関係が心に引っかかる亜美は躊躇してしまう。 敵に捕らわれいよいよ危ないところでうさぎとレイが駆けつける。亜美を思う二人の姿にいつしか亜美の心は開き、自然に「うさぎちゃん」と呼べるようになった。こうして戦士達の絆が徐々に深まっていく。
セーラームーン・マーキュリー・マーズの息もぴったり合い絶好調のセーラー戦士。残るあと一人の戦士さえ現れれば、力を合わせてプリンセスと「幻の銀水晶」を見つけられるはず。 うさぎたちの学校ではバスケットの選手、高２のタケルが女の子の人気を集めていた。うさぎの親友・なるでさえも彼に夢中。毎日のように彼のプレーを見に行く。そんな時一人の少女が転校してきた。木野まこと。生徒達の噂では、前の学校で喧嘩をしてけが人を出したために転校してきたという。同級生達は男勝りのまことを怖がるがうさぎだけは親しみをもって近づいていく。幼い頃に両親を亡くしずっと独りぼっちだったために突っ張った態度をとってしまうまことも、うさぎには心を開いていく。まことと接するうちにうさぎはあることに気がついた。まこともタケルのことが好きなのでは？ 一方ルナはまことが４人目の戦士であるような気がしてならない。 しかし額の三日月の反応は中途半端。一体これはどういうことなのか。 そんな時、まことにタケルからの手紙が届いた.「会いたい」というメッセージ。タケルを好きなまことは手作りのお菓子を作って待ち合わせの場所に。しかし現れたのは意地悪な男の子３人組。傷ついたまことの仇をとるため、うさぎたちはバスケットの試合で決着をつける。ところがその頃、妖魔に取り憑かれたタケルが女の子達のエナジーを吸い取ろうとしていた。居合わせたまことは遂にセーラージュピターに変身。４人目の戦士が誕生した。
転校生・木野まことがセーラージュピターに変身し遂に４人揃ったセーラー戦士。あとは力を合わせて、プリンセスと「幻の銀水晶」を探し出す使命を果たすのみ。気になるのは謎の戦士・セーラーＶの正体だ。果たして彼女がプリンセスなのか？ しかしうさぎは上の空。それよりもタキシード仮面の正体が知りたい。 「彼に近づいてはだめ、絶対に」。秘かに彼への恋心が芽生え始めたうさぎにセーラーＶの言葉が暗い影を落とす。彼女が言うようにタキシード仮面は危険な敵なのか・・・ うさぎが葛藤しているとき、行きつけのカラオケボックス「クラウン」の店員、古幡元基がタキシード仮面の服を広げていた！彼がタキシード仮面？！元基を意識し始めるうさぎ。成り行きで、うさぎ・レイ・まこと対元基とその友達でグループデートをすることに。 待ち合わせ場所に現れた元基の友達とはうさぎと犬猿の仲、地場衛だった！ 男女ペアになった６人は遊園地の乗り物へ。タキシード仮面であるはずの元基と２人になったうさぎだが、なぜか心がときめかない。しかし気を取り直して迷路に入ることに。うさぎと元基、まことと衛ペアで進むが２組とも相手とはぐれてしまう。 元基を探すうさぎが迷路の中で偶然会ったのは衛！「もうはぐれないように」と手をつないだ衛に、うさぎはなぜかドキドキするのだった。そこへうさぎに妖魔出現の連絡が入る。衛に隠れて変身するうさぎだが、迷路の鏡に映ったその瞬間を衛は見逃さなかった。 うさぎがセーラームーン・・・。タキシード仮面である衛にその事実は衝撃であった。
「愛野美奈子マスコットキャラなりきりコンテスト」が開催されることになった。 人気アイドル愛野美奈子がデザインしたキャラクター「ナコナコ」に扮装し、入賞者には賞品が贈られるというものだ。彼女の大ファンのうさぎは大はりきり。 コンテスト準備のために山のような宿題を何とかしようと亜美・レイ・まことに泣きつく。 しかしここでレイとまことが衝突してしまった。自分のことは自分で責任を持つべきだと主張するレイに、仲間は助け合うものだと反論するまこと。二人の間に険悪なムードが流れる。 コンテスト当日。うさぎに頼まれた絵馬をレイのいる火川神社に届けに行くまことは、レイが男と言い争い車に乗り込むところを目撃。「まさか誘拐？！」まことはレイを助けるために走り出す。 一方コンテスト会場に着いたうさぎは会場内の異様な雰囲気に妖魔の気配を感じる。 レイを助けようと後を付けたまことはホテルへ。レイのいる部屋に忍び込む。そこでまことは、実はレイは有名な政治家の娘であり、世間への体裁のためにレイを利用する父親に寂しさを感じている事を知る。今回ホテルに連れてこられたのも親娘の仲を演出するため。 そんなレイをまことは外に連れ出す。自分に一生懸命になってくれるまことにレイも徐々に心を開いていくのだった。 コンテスト会場の妖気はジェダイトだった。力を合わせるセーラー戦士達。ところが突然彼は姿を消した。闇の世界は不穏な動きを見せる。
タキシード仮面がマスコミに声明文を出した！ 「幻の銀水晶」の存在を公開してしまったのだ。さらに「時価数十億円」と煽ったものだから世間は大騒ぎ。 我も我もと自分の持つ水晶を鑑定し、更にタキシード仮面に扮して宝石店を襲う偽者まで現れる始末。 「やはりタキシード仮面は敵だった」とセーラー戦士達は確信するが、彼に恋するうさぎだけは心の中では彼の味方。必ず何か訳があるのだと信じている。 そんな時、日本でもトップクラスの企業から依頼が入った。 社長の家にある「幻の銀水晶」かと思われる石をタキシード仮面から守ってほしいというのだ。 くれぐれもタキシード仮面は敵であると念を押されているうさぎだが、冷静な対処ができるのだろうか・・・ レイの代わりに屋敷の中で問題の石を守る亜美。うさぎとまことは変装して外で見張る。そこへタキシード仮面が現れた！ 警察から彼を守ろうとするうさぎはタキシード仮面に変身、おとりになって警察を惑わす。ところが彼は偽者だった・・・。 うさぎがまぬけなことをしている間に屋敷の中では妖魔が出現。幻の銀水晶を求めるネフライトの仕業。しかし石は偽物だった。 幻の銀水晶はどこにあるのか。鍵となる人物、プリンセスに目を付けたダークキングダム四天王の一人、ゾイサイトが動き出した・・・。
母親と大げんかをして家出したうさぎは、行き場を探してレイのいる火川神社にやって来る。 そこではエリカという少女が子供会のために紙芝居を作っていた。物語は「かぐや姫」。 エリカは亡くなった母親が月に帰ったのだと信じているのだ。同じように母親を亡くしたレイは、エリカに幼い頃の自分を重ね合わせる。その事実を初めて知ったうさぎは、二人の前で母親の文句を言ってしまった事を反省する。 その頃、「プリンセス」というキーワードに関係する人や物に異変が起き始めた。ある国のプリンセスが突然倒れ、ある所では絵本の白雪姫が燃え出す。そしてとうとうかぐや姫に自分を重ねていたエリカまでもが苦しみだした！ 戦士達は必死で妖魔と戦うが、セーラームーン以外は妖魔の声にやられてしまう。ルナの指示でロッドにみんなへの思いを込めたセーラームーンの力で遂に妖魔は消滅した。その時！戦士達の前にクイン・ベリルの幻影が現れた！ ダークキングダムの女王と名乗るクイン・ベリルは、プリンセスの破滅を宣言して消えていった。 残された戦士達は、自分たちが月の王国の戦士であることを聞かされる。
プリンセスと自分たちセーラー戦士は月の世界の人間であるとルナから聞かされうさぎは動揺、他の戦士達も今まで通り戦うしかないと覚悟を決める。 そんな時、人気アイドル・愛野美奈子が交通事故で入院。実はこれはセーラーＶの正体は愛野美奈子ではないかと疑っているゾイサイトの仕業だった。 美奈子の大ファンであるうさぎはこのニュースを聞き、お見舞いに行こうとまことと二人で病院に忍び込む。一方２人に呆れた亜美・レイ・ルナはインターネットで見つけた「星まつり」が気になる。 「星まつり 月と火星と水星と木星大集合 ゲストはＶ」のフレーズに３人はセーラー戦士とセーラーＶを連想する。この情報は入院中の愛野美奈子にも届いていた。行動を開始する美奈子は、病院を抜け出す途中でうさぎとまことにばったり会ってしまう。
セーラーＶである愛野美奈子はセーラームーンの正体・月野うさぎの緊張感のない性格にがっかり。 今までセーラーＶとして戦ってきたことへの空しささえ感じている。 一方美奈子の大ファンであるうさぎは、せっかくもらったサインを取りに戻ろうと美奈子の入院する病院へ再び忍び込む。そこへ追われるように走ってきたのは愛野美奈子！ 仕事がいやで病室を抜け出してきたのだと勘違いしたうさぎは美奈子を庇って一緒に逃亡。 しかし実は美奈子は妖魔から逃れてきたのだ。戦士でありながら妖魔に気付かないうさぎに美奈子はいよいよ呆れる。二人は同じ月の戦士として心を一つにすることができるのか・・・。
セーラー戦士達は、セーラーヴィーナスの言葉「私にはプリンセスとしてどうしてもやらなきゃいけないことがある」に考え込む。そんな時うさぎと衛の前にシンと名乗る少年が現れた。シンは自分が何者なのかも思い出せないというのだ。 ２人はギクシャクしながらも、彼の記憶を呼び戻そうと協力する。 早朝、衛は怪しげな行動をとるシンを目撃する。「俺に近づくな！」と豹変したシンに衛は・・・。
遂に現れた、ダーク・キングダム四天王最後のクンツァイトによって妖魔にされてしまったセーラームーン。しかし彼女の中の戦士の力が妖魔の力を抑え込んだ。 元に戻ったうさぎを見て仲間の戦士達がほっとするのも束の間、うさぎの中の妖魔は徐々に力を持ち始め、遂にうさぎは倒れてしまう。 「私だってうさぎちゃんを守れる！」と必死で看病する亜美。 しかし体温が下がり始めたうさぎの身体には、確実に妖魔の影が現れ始めるのだった・・・。
愛野美奈子の家に泥棒が入った。盗まれたのは宝石箱。 この手の窃盗は盗品がこっそり売られることがあるという。 そんな時うさぎは、有名な宝石デザイナーを母に持つなるに一緒に宝石のオークションに行かないかと誘われた。 しかし待ち合わせの場所に現れたのは地場衛！ うさぎが衛を好きなのだと思いこんだなるがこっそりセッティングしたのだ。 意識しあって気まずい空気が流れる２人。逃げるように帰ろうとしたうさぎが男とぶつかった。衝撃で男がぶちまけてしまったカバンの中にはうさぎも見覚えのある愛野美奈子のアクセサリー入っていた！
ダークキングダム四天王のひとり、クンツァイトによってまたも妖魔が動き始めた。 最近多発している行方不明事件も彼の仕業だったのだ。突き止めたのはレイとまこと。 うさぎは、２人が妖魔と戦っている時に自分は衛と一緒にいたなどとはなかなか言い出せない。 一方学校では、うさぎを巡って亜美となるの仲が悪化。なるのきつい言葉に亜美は深く傷つく。 そんなことがあってから、亜美はたまたま道でなるを見かける。亜美がそっと立ち去ろうとしたとき！ なるが突然地面に開いた穴に引き込まれてしまった！
人間の命の力・エナジーが大量にダークキングダムの手に渡ってしまった。 敵は確実に強くなってきている。しかしうさぎは衛のことで頭がいっぱい。 衛が彼女と２人でいるところに鉢合わせしてしまったのだ。うさぎの様子がおかしいことに気付いた亜美とまことは心配で目が離せない。 そんな時レイは母の命日に訪れた教会で弱った犬を助ける。 そこへたまたま現れたのは愛野美奈子だった！
セーラーヴィーナスは妖魔を取り逃がしてしまったセーラーマーズを厳しく叱りつける。 その強い調子と、何よりも彼女の正体にマーズは驚きを隠せない。 教会で張り合いながら犬の世話をするレイと美奈子の関係も微妙に。 一方まことはうさぎの恋に協力しようと情報収集を開始。 一縷の望みをかけ衛の友人に彼女のことを聞きに行く。ところがなんと彼女は衛の婚約者であることが発覚！ あまりのことにまことは言い出せないでいる。そんな時教会に妖魔の気配が・・・
間もなくバレンタインデー。うさぎは衛に手編みのマフラーを渡したいが彼女の存在が気になりふさぎ込んでいる。そんなうさぎの様子にまことは、彼女が衛と婚約までしていることをどうしても言い出せない。 そんな時うさぎは小学校１年生のひかりという少女に恋の相談をされる。 好きな男の子・大地に真剣にぶつかっていくひかりを見て、うさぎも少し勇気が湧いた。 ２人で励まし合いながらチョコを選んでいる時、偶然衛とその彼女・陽菜が通りかかった。 驚いたことに、陽菜を見るひかりは普通ではない様子。 ひかりと陽菜の意外な関係とは・・・？
最近レイが何かを隠している。実はセーラーヴィーナスの正体を知り、その不思議な行動の謎を解こうと一人で考え込んでいるのだ。 まことはそんなレイの様子が気に入らない。しかしそれ以上に気になるのはうさぎと衛の恋の行方。 まことは遂に、衛が彼女と婚約までしていることをうさぎに話す決意をする。 そんな時、うさぎはあるきっかけで衛とダブルデートをすることになった。 淡い期待を抱くうさぎ。しかし事態は思わぬ方向に・・・。
衛と陽菜が婚約していることを知り、うさぎはショックで家にこもってしまう。 まことはうさぎを励ます方法を考えようと亜美の所へ。ところが亜美の様子がおかしい。 突然遊園地に行きたいと言い出したり、戸惑うまことを尻目に大はしゃぎしたり。 全く人が変わってしまったようなのだ。そして遂にはぐったりと倒れ込んでしまう！
セーラーマーキュリーが敵の手にかかってしまった。 自らを「ダークマーキュリー」と名乗りセーラー戦士達を倒すことを宣言する。 戦士達は戸惑い、全員がバラバラであった最近の状況を振り返る。 皆が自分勝手に行動する中、亜美だけが一人一人に手袋を編みながらまた全員が一つになるのをじっと待っていたのだ。 しかし亜美が敵となってしまった今、正義のためにセーラー戦士はマーキュリーと戦わなければならない。 彼女たちは果たしてどのような決断を下すのか！
ダークキングダムに囚われセーラー戦士の敵となってしまったセーラーマーキュリー。 彼女を元に戻すには、戦士達それぞれが自分の中に眠る力の全てを思い出し目覚めなければならない。 リーダーとして早く目覚めなければと焦るレイは、必死で自分に欠けているものを見つけ出そうとする。 そんな時、セーラーヴィーナス・愛野美奈子の企みで、レイは病院の子供達の前で歌を歌わなければならなくなってしまった。歌は大の苦手。困ったレイがとった行動は・・・。
タキシード仮面の正体を知ったうさぎは驚きを隠せない。 そして図らずも衛に自分の想いを伝えてしまったことに動揺するが僅かな期待を捨てきれないでいる。 一方衛の婚約者である陽菜は、衛が自分を本当に愛しているのかを疑い思いつめている。 衛は必死で本当の気持ちを隠そうとするが、思わぬことから陽菜を傷つけることに。 ２人の関係に決断を迫られた衛は・・・。
衛を思ううさぎの涙で、ダークキングダムにやられた衛が目を覚ました。 同時にルナ・マーズ・ジュピターは本当のプリンセスが誰なのかをはっきりと知る。 そう、月のプリンセスはセーラームーン・月野うさぎだったのだ！！ 遥か昔、うさぎと衛の前世である月のプリンセス・セレニティと地球の王子・エンディミオンは互いに深く愛し合っていた。しかしそれは禁断の恋。 二人の関係は間もなく月の王国と地球に悲劇的な滅亡をもたらす・・・。 ところが前世からの因縁によって深く結ばれた二人は、時を越え再び出逢ってしまったのだ！ 間もなく婚約者・陽菜とロンドンへ発つ衛。うさぎとの今後はどうなるのか。
月のプリンセスと地球の王子として前世から深く愛し合っていたうさぎと衛。 現世でも再び出会い強く惹かれあうが、二人の恋は許されない。 衛は本当の自分を探すため一人でロンドンへ旅立ってしまった。 うさぎは衛を諦め、今は敵にさらわれて悪の心に変えられた亜美を取り戻すことに全力を注ごうと決意する。そんな時、亜美・セーラーマーキュリーの前に一人の戦士が現れる。「あなたはきっと戻ってくる」と言い残したその戦士は何者なのか。また、時を同じくしてうさぎ・レイ・まことのところにも不思議な少女が現れるのだった・・・。
セーラームーンが放つ「幻の銀水晶」の光によって亜美の呪縛が解けかけている。 しかし心の葛藤に苦しむ亜美は、振り切るようにセーラームーンに剣を振り下ろす！ 気が付くとうさぎと亜美は森の中に倒れていた。 呪縛が解けた亜美は、大好きなうさぎとの日々を今になってやっと思い出したのだ。 しかしもう遅い。動かなくなったうさぎを抱いて、亜美は涙を流すのだった。
遂に敵の呪縛が解け、亜美がうさぎたちの元へ戻ってきた。 手を取り合って喜ぶ戦士たち。あとはそれぞれが戦士として完全に目覚め、プリンセスの記憶が戻ることだ。うさぎたちが愛野美奈子の歌をうたいながら亜美のお祝いをしている頃、当の本人、セーラーヴィーナスである愛野美奈子は「黒木ミオ」というライバルの出現に疑問を抱いていた。 最近トップアイドルの美奈子の座を揺るがすほどに勢いづく黒木ミオに美奈子は妙な感覚を覚える。そしてその予感は的中した。 なんと、黒木ミオがうさぎたちのクラスに転校してきたのだ！
うさぎたちのクラスに転校してきたアイドル・黒木ミオは巧みにうさぎに近づこうとする。 あるとき妖魔と戦うためにうさぎがミオを安全な場所に一人で待たせたことから、クラスメートの間で「うさぎはミオを見捨てて一人で逃げた」という噂が広まってしまう。戦っていたことを言えないうさぎはクラスで孤立。 味方のふりをしてうさぎを陥れようとするミオは、愛野美奈子まで巻き込みさらなる罠を仕掛ける！
仲間の中で一人だけ戦士の力に目覚めていないまことは焦りを感じている。 目覚めるためには心の問題が大きいと、戦士たちは協力して的外れの特訓を決行。 案の定何の役にも立たない。 そんな時カラオケ「クラウン」の店員、古幡元基がまことをデートに誘う。 ぎこちなくもデートは進行、遂に元基はまことに告白する！
ロンドンへ行った地場衛が行方不明になった！ 彼を忘れられないうさぎはいてもたってもいられない。 彼との恋は不吉だと説得する仲間の反対も聞かず、なんとかロンドンへ行こうとする。 それに目をつけたのが、同級生でアイドルの黒木ミオ。 アイドル・ユウトの付き人としてロンドンロケに同行することを提案する。 藁にもすがる思いのうさぎは喜んで付き人になる。 しかしこのことを聞いた愛野美奈子は不吉な予感がするのだった・・・。
遂に想いが通い合ったうさぎと衛。 前世からの不吉な恋といわれるこの関係に仲間たちは不安だが嬉しそうなうさぎの様子に引き離すことはできずにいる。 幸せ絶頂のうさぎとは対照的に、母親との距離にずっと寂しさを感じてきた亜美と政治家の父親にずっと恨みを抱いてきたレイに、それぞれの親と正面から向き合わなければならない事態が生じる。
母親を喜ばせたいために、幼い頃から自分を抑えて従ってきた亜美だが転校したほうがいいと言われ、今回ばかりは自分の気持ちを押さえ込むことができない。 一方レイは母が亡くなるとき病院に来なかった政治家の父親をいまだに許せないでいる。親への複雑な思いを抱える二人がとった行動は・・・。
前世から禁じられた関係であるはずのうさぎと衛だが、二人は「前世など信じない」と誓い合い、付き合い始めてしまう。 仲間の戦士も、うさぎのあまりの情熱に強く反対することができない。 しかし二人の関係の恐ろしさを知るセーラーヴィーナスは決して許さない。 なんとか二人を止めようと思案していたとき、彼女の前にゾイサイトが現れる。 二人を引き離すという同じ目的を持つゾイサイトは、ヴィーナスにある提案をする・・・。
セーラーヴィーナスである愛野美奈子はレイに重大な秘密を告白する。 突然の告白にレイは驚きを隠せないが、戸惑っている時間はない。 敵はますます強くなっているのだ。 レイたちが警戒する中、ダークキングダムの女王クイン・ベリルがついに、前世から求めていたエンディミオン・衛の前に姿を現す！
地場衛をクイン・ベリルに連れ去られたうさぎは心配する気持ちを抑え、彼を信じて帰りを待とうとする。 ところがルナが目を離したすきにうさぎは姿を消してしまった！ ルナが最後にハープの音を聞いていることから、うさぎはプリンセスの姿でいるはず。 戦士たちは音を頼りにプリンセスの捜索を始める。 一方、ダーク・キングダムに連れて行かれた衛は前世での家臣、四天王と正面から向き合おうとする。
前世で一体何が起きたのか、遂にプリンセス・セーラームーンの口から真実が語られる。 しかしあまりのことにルナと戦士たちはなかなか気持ちの整理をつけられない。 一方クイン・ベリルにこの事実を聞かされた衛は、ある決意を固める。
セーラームーンに向かって、衛の前世・エンディミオンが剣を抜いた！ 前世の悲劇を繰り返さないためとはいえ、うさぎは愛する衛に宣戦布告されてしまったのだ。 しかしうさぎの気持ちは変わらない。健気に衛を信じ続けている。 そんな時、思わぬ縁で、愛野美奈子の事務所の社長がうさぎの母にテレビレポーターの仕事を依頼する！
星を守るのは自分自身だと衛に教えられたうさぎは地球を滅ぼす力のある「幻の銀水晶」のパワーを抑え込む決意をする。 一方愛野美奈子は、残り少ない命を前世の使命を果たすためだけに生きるため、歌を辞める決心をする。 そんな矢先、事務所の社長から美奈子の仕事はある新人に交代することを告げられる。 突然仕事を奪われ、驚く美奈子の前に現れた新人アイドルの正体とは！？
夏休みに入り、うさぎたちの学校ではボランティアの宿題が出た。 クラスメイトのなると、うさぎ・亜美・まことは、児童館で子供の世話をすることに。 子供たちにてこずる中、うさぎには一つの計画があった。 まことに内緒で元基を呼び出し、二人きりにするのだ。 何も知らないまことは子供の洗濯物を抱えて裏庭へ。 そこへ元基がやってきて・・・。
クイン・メタリアの力は強なる一方。 うさぎがその力を抑えられなければ地球は滅んでしまう。 なるや仲間に励まされ、うさぎはメタリアの力を制する訓練を始めるがどれも的外れな修行ばかり。とても地球を救うに値するものとは思えない。 一方ダーク・キングダムでは、ジェダイトがベリルに忠誠を誓う。 どうしてもエンディミオン（現世の衛）を手に入れたいベリルは、ジェダイトにある指示を与える。 ベリルに渡された謎の石を手に、ジェダイトは衛に近づいていくのだった・・・
クイン・ベリルによって命を吸い取られる石を埋め込まれてしまった衛。 うさぎを思えば思うほど死が近づく。 それを知ったうさぎは怒りがこみ上げる。するとうさぎに変化が・・・。 この変化に気づいた衛は自分の中の石の存在をかえりみず、うさぎに会う決意をする。 許された時間は日没まで。戻らなければクイン・ベリルに命を奪われてしまうのだ。
前世の受け止め方について対立するレイと美奈子。 レイは、美奈子は戦士の力に目覚めていないため戦う資格がないと主張するがそこにはある思いがあった。 一方どんなに望んでもエンディミオンの心が手に入らないと思い知らされたクイン・ベリルは遂にプリンセスの命を奪うことを決意する！
遂にセーラーヴィーナスが倒れてしまった。 まことと亜美は彼女の容体が普通でないことに気付き始める。 アルテミスは必死に手術を勧めるが、前世の使命を果たすためだけに生きようとするヴィーナスは一向に聞き入れようとしない。 そんな時またもや妖魔が現れた。 ヴィーナスの、使命を果たそうと命を懸ける姿勢に心を打たれたまことはとんでもない行動に出る。
命を捨てて前世の使命を果たそうとするまことの姿を見て、美奈子は前世に囚われている自分を省みる。 一方、ミオに連れられダークキングダムにやって来たレイはそこで衛と対面する！
ヴィーナスが遂に戦士の力に目覚め妖魔を倒すことに成功。 そして手術を受ける決心をする。 仲間の戦士は手術の成功を信じてパーティを計画。 美奈子は笑顔で手術前の検査に向かう・・・
美奈子の死を受け止めきれない戦士たちだが、星の運命を変えるために、彼女の分も精一杯戦う決意をする。 一方衛は命を懸けて星を守ろうと恐ろしい行動に出る。 破壊のエネルギーが充満するクイン・メタリアを自分の体内に封じ込めてしまったのだ！
セーラームーンが、メタリアと一体化したエンディミオンを剣で貫いた！ しかしエンディミオンを殺した事実を認識したセーラームーンはショックのあまりプリンセス・セーラームーンに変化、星もろとも全てを終わらせようとする！ やはり前世は繰り返されてしまうのか？！ 「美少女戦士セーラームーン」衝撃の最終回！！
オーディションにおける裏話や中高生時代の5人が仲を深めるきっかけになった撮影秘話など、今だからこそ話せるお互いの関係性にまつわるエピソードが満載のトークバラエティ番組になっています。
