チャペルの子供たち率いるスティンガー部隊との戦いを終えた涼たちは、研究所でARMSの元となったシリコン生命の「アザゼル」を目の当たりにする。 そんな中、エグリゴリ直属部隊「イプシロンフォース」が、ギャローズ・ベルに総攻撃を仕掛けようとしていた。