ב-5 בספטמבר 1972, מחבלים מארגון "ספטמבר השחור" פורצים למגורי הספורטאים הישראלים באולימפידת מינכן, הם רוצחים שניים ומחזיקים תשעה כבני ערובה, הממשל הגרמני נכשל בפעולת החילוץ, וכל בני הערובה נרצחים. ממשלת ישראל, בראשות גולדה מאיר, מחליטה לחסל את כל חברי ארגון "ספטמבר השחור" שהיו מעורבים בפיגוע.
פעילי ספטמבר השחור נחשפים דרך מאבקיהם האישיים. אבו-איאד רדוף על ידי עברו, בעוד סלאמה נאבק בנג'אר על כוח. הררי מקים צוות חיסול באירופה ומצליח להתנקש בפעיל מרכזי בפריז.
מקור מוסד חודר לספטמבר השחור אך נחשף, ומסכן את צוות המוסד. סלאמה ואבו-איאד מתכננים פיגוע ברומא. המוסד מנסה להתנקש בסוחר הנשק שלהם, אך זמיר מבטל כדי למנוע פגיעה בחפים מפשע.
סלאמה מתכנן להבריח טילים נגד מטוסים לאיטליה כדי לפגוע במטוס שעליו נמצאת גולדה מאיר. אבו-איאד עובר למצרים אך נתון בלחץ מהשלטון. המוסד מצליח במשימתו, אך זה כבר מאוחר מידי.
המוסד מגלה על התוכנית של חברי "ספטמבר השחור" ועל כוונתם לפגוע בגולדה מאיר ברומא. הצוות האירופאי ממהר לאיטליה כדי לעצור את הפיגוע. סלאמה מפקח על המבצע והמתח בארגון גובר.
דאוד, חבר בספטמבר השחור, נעצר בירדן. כדי ללחוץ לשחרורו, סלאמה מתכנן פיגוע בשגרירות סעודיה בסודן. חיסול שגריר ארה"ב מוביל לשיתוף מודיעין קריטי עם ישראל.
המוסד מתכנן לחסל מנהיגי מפתח של ספטמבר השחור באמצעות יחידות קומנדו. זמיר שולח את המרגלת הלן לאסוף מודיעין בביירות. שלושה ממחבלי מינכן מגיעים לביירות והמוסדיוצא למבצע.
צוותי הקומנדו מגיעים לביירות בעזרת הצוות האירופאי של הררי. סלאמה מתעמת עם אשתו. מבצע המוסד מצליח, שלושה בכירים בספטמבר השחור מחוסלים, אך המרגלת הלן נתקעת בביירות.
