Soul erholt sich langsam von seiner schweren Verletzung durch den Kampf mit dem Dämonenschwert Ragnarök, dessen schwarzes Blut in ihn eingedrungen ist. Gepflegt wird er von der Schulärztin Doktor Medusa, die in Wirklichkeit jedoch eine Hexe ist, die unter Seelenprotektion in der Shinigami-Schule arbeitet, um teuflische Experimente mit Waffen und Meistern durchzuführen.
Soul reveals to Medusa that since his battle with Ragnarok, he has continuous nightmares featuring an imp-like creature and Maka. Medusa tells him not to worry, but deduces that it could be linked to Soul's body being infected by Ragnarok's blood. Meanwhile, Stein gives Black Star a cup with a mysterious liquid as part of his training to cope with Tsubaki's new abilities, but when Maka asks him to have a special training too, he states that there is still something she is missing, and must realize what it is first. Elsewhere in the city, Medusa gets cornered by Eruka Frog and Mizune, two other witches who suspect of her intentions, and decided that she is too dangerous to live. However, Medusa reveals to them that she previously had implanted magic snakes in their bodies and easily kills Mizune. Eruka manages to escape after Maka and her friends appear to investigate.
Maka et Black Star, bien décidés à devenir plus forts, demandent au professeur Stein de leur préparer un entrainement spécial. Pendant ce temps, Medusa est prise à parti par deux autres sorcières, Elka et Mizuné, qui ne voient pas d'un bon oeil son infiltration de Shibusen et ses expériences sur le Grand Dévoreur...
Due streghe, Eruka Frog e Mizune, hanno una discussione con Medusa in cui le annunciano di essere scettiche nei confronti dei suoi esperimenti alla Shibusen. Successivamente, dopo una visita, Soul parla a Medusa del suo incubo ricorrente in cui, dopo aver parlato con un demonietto rosso, emerge dalle viscere di Maka (tale incubo è un effetto dell'infezione da parte del Sangue Nero). Maka, nel frattempo, dopo aver assistito all'allenamento di Black Star (per poter usare la Lama Incantata a piena potenza) si rimprovera, a causa della sua debolezza, di essere stata la causa della ferita di Soul, in Italia, e si ripromette di diventare più forte per fare in modo che una cosa del genere non accada mai più. Medusa è poi attaccata da Eruka Frog e Miuzune, ma rivela loro di aver introdotto nel loro corpo dei serpenti magici che ubbidiscono ai suoi ordini durante il primo incontro: Mizune viene uccisa dal serpente, mentre Eruka riesce a scappare, ma viene raggiunta da Medusa. Per potersi liberare dei serpenti che ha in corpo, Eruka dovrà eseguire gli ordini di Medusa: il suo primo compito è infiltrarsi nella prigione delle Streghe e liberare il prigioniero noto come "numero 13".
魔女ミサ終了後、メデューサは同じ魔女のエルカとミズネに絡まれていた。彼女達は、魔女の敵・死武専へ単独潜入しているメデューサを危険視していたのだ。一方、ソウルは頻繁に現れる謎の小鬼の夢に、そしてマカは今の自分の弱さに焦りを感じていた。それぞれの思いが交錯する中、エルカとミズネはついにデス・シティでメデューサを急襲するが…。
В Академии всё идёт своим чередом. Но планы ведьмы Медузы на месте не стоят.
Black*Star empieza un entrenamiento que le ha puesto el profesor Stein para que pueda controlar el nuevo poder de su espada, Maka al enterarse, también quiere empezar un entrenamiento pero al parecer no está preparada, ya que debe enfrentar el remordimiento que tiene al ver la herida de soul.
