The Turtles need parts to rebuild the time machine that brought them to the future. However Cody's shady uncle and caretaker Darrius Dun has other plans...
Á espera da abertura da ''Janela do Tempo'' para retornar, as Tartarugas saem com Cody e vão para O'Neil Tech. Porém, Darius descobre e quer nossos amigos longe de Cody e seu laboratório de estudos. Alucinado manda seus mercenários atacar nossos heróis.
Turtles håber at de kan lave tidsvinduet og komme hjem igen, de sniger sig ud sammen med Cody. Darius ser dem, og vil have Turtles ind i hans laboratorium. Han løslader nogle lejesoldater for at fange Turtles, det ser ud til at det lykkes, indtil de vender sig imod ham og kidnapper Cody. turtles bruger ny teknologi til at lave nye våben, og begiver sig ud på en farlig redningsaktion.
