Dante, un professore di filosofia, torna a Roma dopo anni per occuparsi del figlio Simone. Tra i due i rapporti sono tesi, complice anche il fatto che il padre si ritrova ad insegnare nella classe del figlio, e che Simone vive una crisi con Laura, la sua ragazza. Per fortuna Virginia, la nonna, si trasferisce da loro.
Simone lascia Laura senza spiegazioni. Dante si accorge della sofferenza della ragazza, le suggerisce di provare a farsi rispettare e lei decide di ferire Simone dicendogli di essere incinta. Intanto, il professore incontra Anita, madre di Manuel, tra loro c'è attrazione ma anche tensione, a causa di una comune esperienza passata.
Dante spiega alla classe Kant e la legge morale. Rivede Anita e le chiede di non raccontare a Manuel le circostanze in cui si conobbero: lui a Simone non ne ha mai parlato. Simone ruba la versione di latino per il compito in classe e decide di condividerla con Manuel, da cui si sente attratto. Dante li scopre e reagisce a modo suo.
Dante illustra a Pin il mito della caverna di Platone, cercando di scuoterlo. Alla classe spiega l'amore secondo il filosofo greco. Alla lezione assiste anche Cecilia e ne resta conquistata. Manuel riceve da Sbarra due incarichi: nascondere un'auto che scotta e spacciare. Dante intuisce che Manuel si sta mettendo nei guai e ne parla con Anita.
Dante tiene una lezione sulla felicità in Aristotele e chiede ad ognuno di scrivere su un biglietto cosa sia la felicità. Fuori da scuola, continua il corteggiamento con Cecilia, mentre Anita riceve le attenzioni galanti di Ettore, il suo ex. Mentre Dante con uno stratagemma fa uscire da casa Pin, Sbarra fa picchiare Manuel per il ritardo nel riconsegnare l'auto.
Anita è molto grata a Dante per come sta cercando di aiutare Manuel e lo bacia. Convinto che Simone e Manuel non dicano la verità, Dante porta la classe a Campo de' Fiori dove tiene una lezione su Giordano Bruno che per la verità sacrificò la vita. Il Professore va poi a trovare Mimmo, suo studente di Torre del Greco finito in prigione.
Dante tiene una lezione su Michel Foucault per far riflettere i ragazzi sul concetto di omologazione e sul disprezzo per chi è ritenuto diverso. Poi cerca un confronto con Simone, ma lui è chiuso a riccio. Anita scopre nella rimessa l'auto di Sbarra distrutta da Simone e la mostra a Dante: ora sono sicuri che Manuel è nei guai.
La visita di classe al museo diretto da Cecilia viene interrotta da un fatto increscioso: l'ex di Monica ha postato un filmato osé della ragazza. Dante tiene una lezione su Guy Debord e la società dello spettacolo. I ragazzi si dimostrano subito solidali con Monica e Dante rintraccia lo stalker e gli dà una lezione.
Il segreto che angustia Dante non lo rende sereno e disponibile e per questo reagisce male con Anita. Intanto in classe tiene una lezione su Schopenhauer e il pessimismo, per spingere i suoi alunni a reagire al dolore. Mentre Sbarra affida a Manuel una pistola, con cui dovrà minacciare un suo creditore, Simone decide di organizzare per il suo compleanno una festa clandestina a scuola.
Dante si riavvicina ad Anita e le chiede scusa per come l'ha trattata, ma ancora non riesce a parlare del suo passato, soprattutto con Simone. La scuola è inagibile dopo la festa e Dante porta la classe al Colosseo per spiegare Rousseau: la scelta di infrangere la legge organizzando la festa è un atto di libertà o di anarchia?
Manuel si confida con il prof, ammettendo di aver lavorato per Sbarra e che ora è Simone ad essere nei guai visto che Sbarra gli ha affidato l'incarico di bruciare una libreria. Dante è sconvolto e si confida con Anita, nella quale vede un'anima sempre più affine. Un evento tragico che coinvolge Simone porta Dante a rivivere il dramma che gli ha segnato la vita.
Dante è un professore di filosofia molto particolare. Alessandro Gassmann ce lo presenta e ci racconta della sua vita.
Dante propone ai suoi alunni un metodo di studio diverso, in cui il professore, oltre ad essere un docente, è anche un amico, una figura di riferimento. Qual è il rapporto che instaura coi suoi ragazzi? Ne parla il protagonista Alessandro Gassmann
Nella classe di Dante ci sono suo figlio e Manuel, un ragazzo che ha una madre, Anita, che è stata presente nel passato del professore. Che rapporti si creano tra loro? Rispondono gli attori del cast, tra cui Alessandro Gassmann e Claudia Pandolfi.
Quest'anno la classe si arricchisce di nuovi allievi nella quale però possiamo ritrovare "gli eccessivamente vivaci alunni" della scorsa stagione . Ci saranno come sempre posti bellissimi da visitare, senza mai dimenticare la filosofia e quel modo di insegnarla tipico del Prof. Dante. Parola al protagonista, Alessandro Gassman.
Quest'anno ci saranno nuovi alunni nella classe del Prof. Balestra tra i quali Mimmo che, dopo aver scontato un periodo di redenzione, gli viene data l'opportunità di collaborare con la scuola. All'orizzonte anche problemi "logistici" che riguarderanno Anita ed il figlio Manuel. Parola agli attori, Claudia Pandolfi e Domenico Cuomo.
Nella nuova stagione ritroviamo Manuel, questa volta alle prese con una madre sbadata e uno sfratto imminente! Intanto fa ritorno inaspettatamente un'altra di madre, quella di Simone che troverà rifugio nella casa del Prof Dante, assieme ad altri "nuovi" ospiti. Sarà un momento per fare i conti col passato. Parola all'attrice Christiane Filangieri.
Thomas prende sempre più una brutta china, ma Simone e Dante se ne rendono conto e cercano di scoprire in che guai si stia cacciando. Alba viene minacciata di nuovo, e questa volta Dante decide di intervenire. Prova anche a far cambiare idea ai genitori di Zeno contrari a mandarlo in gita, iniziativa che indispone Irene...
Studenti e professori della 5ªB vanno in gita a Montecassino. Simone ha scoperto la verità sul lavoro di Thomas e ora ce l’ha con lui perché gli ha mentito. La notte, mentre Leone guida una spedizione nel bosco per vedere le stelle, Dante con una scusa si allontana per restare solo con Anita. Mentre Simone e gli altri cercano Zeno, che è nei guai per aver mentito ai genitori e si è allontanato dal gruppo, Thomas e Greta si ubriacano e si appartano. Constatando che tutti e tre provano sentimenti reciproci, Laura, Luna e Matteo decidono di sperimentare un nuovo tipo di relazione.
Studenti e professori fanno i conti con quanto è successo la notte della gita: Greta è a disagio con Thomas, Simone ha molti dubbi sul suo futuro, Zeno non vuole più andare a scuola. Manuel scopre che rischia di perdere l’anno, e capisce che è arrivato il momento di riprendere in mano la sua vita. Intanto, l’esperimento di Laura, Luna e Matteo di una relazione a tre non va come previsto. Riflettendo sul passato, Dante fa un passo ulteriore per aiutare Alba, ma rischia di peggiorare le cose. Viola vuole fare una sorpresa al prof Leone per dimostrargli quanto tiene a lui e alla sua materia, ma lo vede con Anita e cambia idea. Anita, però, si rende conto di essere ancora presa da Dante, e fa una scoperta sconvolgente.
Manuel è finalmente tornato per la gioia di tutti, soprattutto di Anita, che però non riesce a dire a nessuno quello che ha appena scoperto. Greta, ferita dai problemi con Simone e Thomas, e soprattutto dalla verità su suo padre, che Irene le ha sempre tenuto nascosta nel tentativo vano di proteggerla, si sente sempre più sola e depressa, ma trova un inatteso confidente nel redivivo Manuel. All’insaputa di Laura, Matteo e Luna si lasciano andare alla passione. Dante si mette in pericolo per aiutare Alba a liberarsi dai suoi persecutori, e lei gli confessa il proprio ruolo nella morte di Gabriele.
Leone rivela a Dante che Gabriele non è morto per un incidente. Dopo alcuni messaggi inquietanti di Greta, Irene, Dante, Manuel e Simone corrono a cercarla. Anita nasconde ancora il suo segreto, mentre Simone e Thomas ritrovano equilibrio. Zeno sostiene Viola, ma Dante, scosso da tutto, vacilla nelle sue certezze.
Dante riceve una visita a sorpresa dagli studenti che cercano di farlo tornare sui suoi passi. Manuel, vedendo Anita in difficoltà, rivela al professore il segreto che lei non riesce a confessare. Sconvolto ma colpito, Dante inizia a guardare al futuro con occhi diversi. Greta sta meglio e stringe con lui un patto. Alba studia per la maturità con Leone. Anita e Dante, finalmente, si parlano davvero
Mesi dopo, la maturità è alle porte e la tensione cresce. Dante è tornato a essere il prof che tutti conoscono e sostiene la 5ªB nel momento decisivo. La notte prima degli esami Simone crolla, e Manuel corre ad aiutarlo. Arriva il grande giorno: i ragazzi devono affrontare l'ultimo, severissimo ostacolo
In questa stagione ci sono tantissime novità a partire dalla Quinta B; l'arrivo della nuova Preside; il nuovo docente Leone e il tanto temuto esame di maturità. Parola ai "prof" Alessandro Gassman e Claudia Pandolfi!
Quest'anno sarà l'anno più "rivoluzionario" della Quinta B: un anno molto intenso dentro e fuori la classe... con una sorpresa che ci lascerà di stucco. Parola agli "studenti" Damiano Gavino e Nicolas Maupas.
Nuovi studenti, nuovi prof, una nuova preside e sempre tanti problemi da risolvere. La pazzia, migliora la vita? Questo e tanto altro nella nuova stagione di "Un professore". Parola agli attori.