Des billions de bactéries colonisent le corps humain. Chaque individu est un monde à part entière, abritant ses propres écosystèmes. La bonne santé est une question d'équilibre entre bactéries bénéfiques et bactéries nuisibles. Car si certaines bactéries sont indispensables à la bonne marche de l'organisme, d'autres, venues de l'extérieur, peuvent lui être fatales. Ainsi, si une brèche se forme, lors d'une coupure sur un doigt par exemple, l'organisme humain déclenche des mesures d'urgence : saignement pour absorber les intrus, globules blancs qui capturent, digèrent, analysent et communiquent pour parer à l'infection, mise en place du processus de cicatrisation. Normalement, seuls le coeur, les poumons et la vessie sont exempts d'envahisseurs.