Nobita and Doraemon use time tree Mochi and catches a big bird Moa, which has been extinct for 500 years ago. To protect extinct the animal, Nobita and Doramon go to Beremon Island which is protected by a golden beetle named Herakles. They meet a girl from the Rokkoro tribe and a boy who looks exactly like Nobita on Beremon Island.
Nobita quiere competir con Gigante a ver quién tiene el escarabajo más grande. Para conseguirlo le pide ayuda a Doraemon, y ambos viajan a la isla de Belegamond, donde habitan especies ya extintas. Allí conocerán a la profesora Kelly y, después de eso, Nobita intentará robar uno de los escarabajos, pero Doraemon le hace devolverlo. Tras esto, Kelly les contará la leyenda del mítico escarabajo Hércules dorado, el cual tiene el poder de mantener con vida a los animales del pasado. El malvado cazador Sherman intentará hacerse con él, y será la tarea de Doraemon y Nobita impedirlo para salvar, no sólo al escarabajo, sino a la isla entera.
「タイムトリモチ」で500年前に絶滅（ぜつめつ）した幻の鳥・モアを捕まえてしまったのび太とドラえもんは、絶滅動物を保護しているベレーガモンド島に、モアを連れて行くことに。そこは、「伝説のゴールデンヘラクレス」と呼ばれる、黄金のカブトムシの力に守られた不思議な島だった。
のび太たちは、島に住むロッコロ族の少女コロンや、のび太そっくりの少年・ダッケらと仲良くなる。ところが、悪の商人・シャーマンとその手下たちが伝説のゴールデンヘラクレスを狙っていて…！
