Seriestart. Året är 1994 när en plötslig nödsignal går ut på Östersjön. MS Estonia är på väg att sjunka. Prästen Mikaela Karlsson, ingenjören Henri Peltonen och räddningsdykaren Ari Luoma-aho kämpar på varsitt håll för att få grepp om situationen.
Haverikommissionen, med representanter från Sverige, Estland och Finland, möts för första gången. De konstaterar att vraket måste hittas. Mikaela Larsson söker information till de anhöriga och Henri Peltonens ingenjörskunskaper sätts på prov.
En lång och svår natt väntar för besättningen på MS Silja Europa när de beslutar sig för att vända sitt skepp och komma till Estonias undsättning. Vrakets hittas, men nya frågor väcks när undervattenskamerorna närmar sig havsbotten.
En nödboj hittas längs med Estlands kust och skickas vidare till Finland för undersökning. Konflikterna växer inom haverikommissionen när Sveriges ordförande Erik Claeson vägrar dela med sig av allt videomaterial från vraket till övriga länder.
Överlevaren Janek Tamm kallas in för sitt sjunde förhör hos haverikommissionen. Henri Peltonen försöker att ta fram en komplett tidslinje över händelseförloppet, men Tamms berättelse förändras gång på gång. Går det verkligen att lita på honom?
Bröderna Axel och Lucas befinner sig på båten hem från en affärsresa i Tallinn när deras hytt plötsligt fylls med vatten. Haverikommissionen behöver en ny ordförande, och när flera representanter avgår riskerar hela utredningen att falla isär.
En estländsk dansare och en svensk kvinna kämpar för sina liv i det kalla vattnet efter att Estonia sjunkit. Peltonen gör sitt bästa för att hålla igång utredningen, men när budgeten dras åt väljer han att ta saken i egna händer.
Säsongsavslutning. Haverikommissionen bestämmer sig för att publicera sin slutrapport. Överlevande och anhöriga söker rättvisa och samlas för att hedra alla som mist livet.
