Nach den Ereignissen während des Rückblicks in Silent Möbius: The Motion Picture hat Katsumi nur noch eines im Sinn: So schnell wie möglich aus dieser schrecklichen Stadt zu verschwinden, in der sie niemanden kennt und keine Freunde hat. Doch dabei stößt sie auf ernste Hindernisse, denn die AMP hat ihren Plan, Katsumi in ihr Team aufzunehmen, keineswegs aufgegeben.
Ziellos läuft die junge Frau durch die Straßen Tokios, bis ihr schließlich eine andere Frau über den Weg läuft, deren Schicksal mit dem ihrigen auf seltsame Weise verbunden zu sein scheint. Beide haben eine Vergangenheit in dieser Stadt, die mit einer geheimnisvollen Brücke zusammenhängt - einer Brücke, die Katsumi in ihrem Traum gesehen hat...
After the dreadful events related to her mother, Katsumi Liqueur has just one thing in mind: To leave this horrible town as fast as possible, a town where she knows nobody and has no friends. But she soon faces serious obstacles as Rally Cheyenne, the commander of the Attacked Mystification Police, hasn't given up her plan to recruit Katsumi for her team in order to defend the citizens against the Lucifer Hawk demons. And the AMP aren't the only ones interested in making use of Katsumi's magical powers...
A.D. 2024. Katsumi Liqueur vient tout juste de perdre sa mère, emportée par un Lucifer Hawk, des créatures démoniaques venues d'une autre dimension. Après qu'elle ait déposé une gerbe de fleurs sur le lieu du drame, Lebia Maverick, officier de l'AMP, lui donne une sorte de grimoire ayant appartenu au père de Katsumi, lui aussi un puissant magicien avant sa mort. À l'aéroport qui doit la ramener à Hawaï, la jeune femme a la désagréable surprise de voir que son passeport n'est plus valide car sa nationalité a été changée sans qu'elle n'en sache rien. Au-dehors, Kiddy et Nami, deux autres représentantes de l'AMP, l'informent qu'elle doit régler le problème avec Rally Cheyenne, la tête de cette brigade de police si particulière. Celle-ci dit à Katsumi qu'elle ne peut pas la laisser partir car l'AMP, mais aussi le monde entier, a besoin d'elle. Katsumi, encore traumatisée par la perte de sa mère, quitte le bureau, hors d'elle et jurant qu'elle n'utilisera jamais de magie. Plus tard, elle fera la rencontre de Yuki Saiko, une jeune femme très gentille que Katsumi ne connait pas mais qui affirme la voir souvent en rêve...