日常的に怪獣の脅威にさらされる日本。怪獣を討伐する「日本防衛隊」への入隊を目指していた日比野カフカは、夢をあきらめ怪獣専門清掃業で働いていた。防衛隊第3部隊隊長として活躍する幼馴染・亜白ミナとの、ともに怪獣と戦うという約束を想いやるせなさを感じる日々の中、カフカは、防衛隊員を志す後輩・市川レノと出会う。
Kafka Hibino s’était juré de rejoindre les Forces de Défense japonaises et d’exterminer tous les kaiju. Les aléas de la vie en ont voulu autrement, et il occupe désormais un poste de nettoyeur. L’arrivée du jeune Reno Ichikawa dans son équipe va réveiller ses ambitions oubliées.
Hibino Kafka hat sich sein Leben anders vorgestellt. Ursprünglich wollte er dem Verteidigungskorps beitreten und dabei helfen, die Kaijūs allesamt auszulöschen. Stattdessen arbeitet er für eine Kaijū-Beseitigungsfirma, die die Kampfschauplätze von den Überresten der Kaijūs säubert. Sein Leben ändert sich, als er einen neuen Kollegen bekommt.
Kafka Hibino ha quasi abbandonato il suo sogno di unirsi alla "Forza di Difesa" anti-Kaiju. Ora lavora alla pulizia, eliminando i corpi dei Kaiju uccisi e ripensando con rammarico ai giorni trascorsi con la sua amica d'infanzia Mina Ashiro, capitano della Terza Divisione delle Forze di Difesa.
Kafka trabaja como limpiador de cadáveres de kaiju, aunque en realidad quiere formar parte del Cuerpo de Defensa que los enfrenta, pero reprobó el examen varias veces y perdió la esperanza... hasta que llega un nuevo compañero de trabajo.
A Terceira Divisão da Força de Defesa Anti-kaiju do Japão é a mais poderosa e popular equipe de combate a kaiju, monstros gigantes que atacam a Terra. Mas nesta história, acompanhamos Kafka, um faxineiro que há muito tempo abandonou seu sonho de entrar na Força de Defesa...