ある秘宝を狙い、孤島に侵入するルパン三世。そこでルパンは美しくも妖しい女怪盗「峰不二子」と出会う。そのふたりの邂逅（かいこう）が、物語の始まりを告げる……。不二子の前に現れる4人の男たち……ルパン三世、次元大介、石川五ェ門、銭形警部。決して交わってはいけない5人が予測不能な軌道を描きながら、ぶつかりあい火花を散らす！
有名なフランスの泥棒アルセーヌ・ルパンの孫であるルパン三世は、世界で最も熟練した泥棒であり、最もエキゾチックな宝物を盗むために世界中を旅しています。 変装と複雑な計画の達人である彼は、無愛想な大介の次元と静かな武士の五右衛門に助けられています。 彼はインターポールインスペクターの銭形が彼を捕まえようとする試みに簡単に打ち勝ちますが、彼のセクシーで神秘的なライバルである藤子、時には味方に絶えず挑戦されています。
1981年、東京。昼は喫茶店を営み、夜は怪盗キャッツアイとして世間を騒がす美人三姉妹、瞳・泪・愛は、美術展から一枚の絵画を盗み出す。同じ頃東京に現れた、神出鬼没の大泥棒・ルパン三世。彼もまたとある武装組織を出し抜き、絵画を盗むことに成功した。両者が盗んだ絵はどちらも、画家ミケール・ハインツの描いた作品――三連作「花束と少女」の一枚。キャッツ三姉妹にとっては、父であるハインツの消息を掴むための重要な手がかり。伝説的な泥棒の“獲物”が自分たちと同じであると知った彼女たちは、その眼差しに美しい闘志を宿す――