ついに、秘密結社レギオンが動きはじめた。
花園診療所に現れたカリート（和泉崇司）にドク（ミッキー・カーチス）と智（齋藤めぐみ）を人質とられたシャンイン（三吉彩花）は、抵抗できないまま誘拐されてしまう……。
事態を知った獠（上川隆也）たちだったが、シャンインを助けたい一心のシンホン（三浦翔平）とは反対に、冴子（高島礼子）はあきらめることを提案する。世界的な犯罪組織であるレギオンと正面から戦えるわけもなく「もう大切な人を失いたくない」と言うのだ。
冴子の賛同が得られないまま、獠たちはシャンインを取り戻すために動き始める。
いま、シティハンターとレギオンの決戦がはじまった―――。
