Treasure-hunter Ramos invites Fujita on a hunt for treasure along the Amazon river, and they are accompanied by Professor Yoshioka. They eventually find a complete Mayan city underground, but are captured by the villagers who plan to sacrifice Sara to their gods. However Fujita uses a dinosaur-like carving to activate a secret switch which releases the huge Pororoca tidal wave, into the underground cavern. While they are being swept underwater, they see what appears to be a huge pliosaur.
「エルドラドはアマゾンにある」そう言い残し息絶えたペドロ。生前、世話になっていたラモスは、ペドロが残した翡翠の恐竜を持ち、フジタ、サラと共にアマゾンへ向う。同行したのは、TV番組のクルーと、考古学の権威・吉岡助教授。
ところが、着いてみると、そこは何の変哲もない村。期待を裏切られたTVクルーは怒り出してしまう。
しかし、村人は何かを隠していると睨んだラモスは、フジタにペドロの死体にはマヤ文字に似た奇妙な刺青が彫られ、驚くことに、心臓が抜かれていた事を語る。そして、深夜、村長を追い、ジャングルの奥地へ入っていくフジタ、ラモス、サラと吉岡は神殿を発見する。中に入る一同だったが、村人に見つかり、取り押さえられてしまう。