優秀な医学者・鈴木元（堺雅人）は、クローン技術の革新的な発見をする。だが倫理上の問題から上司の榊原道隆（伊武雅刀）から反対を受け衝突、大学の研究室を追われることに。7年後、地方の医者となっていた鈴木は、探偵を使って探していた田代めぐみ（伊藤歩）が遺体で見つかったことを知る。彼女には6歳の息子・新児（高橋來）がおり、奔放なめぐみとは10年近く音信不通だった妹のなつみ（尾野真千子）が引き取ることに。
突然現われた姉の息子との生活になじめず、経済的な事情もあり、なつみは病院で出会った父親を名乗る鈴木に新児を預ける。だが、鈴木の新児への執着に違和感を覚え、なつみも同行を決意。一方、めぐみの死は他殺と思われ、捜査一課の警部補・黒岩忠嗣（高橋克実）も鈴木に着目する。鈴木に関する聴取で黒岩と面会した榊原は、新児の存在を知り驚愕。新児は、鈴木が発見した技術を使った“クローン人間”なのではと疑念を抱く。
