A desperate situation calls for extraordinary measures by the 15th Tactical Squadron, and the mysterious Zor, if the Earth is to survive the final offensive mounted by the Robotech Masters, as they try one last time to recover their rapidly mutating supply of Protoculture, before the arrival of the Invid.
Nova detiene su plan para detener Musica, pero las fuerzas de GMP montar en las tumbas. Los Maestros Robotech emplear todos sus soldados como tropas especiales de choque y desplegarlos en contra de las fuerzas humanas para ganar tiempo para que algunos de sus barcos para recuperar la Matriz de Protocultura.
决战正在太空中激烈的进行。随着战斗逐步升级，机器人统治者发现旗舰已不堪重负，于是下令抛弃所有伤员和百姓，并给克隆人战士注射了止痛血清以使军队能战斗更久，这种残忍手段给了统治者最后的优势。
废墟里，诺娃坚持要逮捕缪西卡。为维护缪西卡，戴纳和诺娃爆发了激烈争论。但鲍威尔和戴纳的话最终打动了诺娃，诺娃改变了初衷。
为在外围狙击敌人，爱默森舰队不得不疲劳应战，在泰洛人的猛烈攻势下渐渐坚持不住。但他的支援请求却遭到伦纳德司令的拒绝。这时泰洛人的登陆艇已强行登陆地球，伦纳德也收到了机器人统治者的最后通谍，要求所有人类在38小时内全部撤离地球，否则就摧毁地球。伦纳德把最后期限拖延到了48小时，同时下令全军紧急集结，准备决一死战。
三星旗舰力战不敌，玛丽和布朗救出了爱默森将军，但在撤退过程中他们不幸被俘。与此同时，机器人统治者和废墟上的佐尔等人取得了联系。他们以被俘的爱默森将军和玛丽、布朗为条件，要挟缪西卡和佐尔回到自己的阵营。佐尔答应了交换条件，他和戴纳决定了一个冒险计划。
15小队带着缪西卡进入泰洛母舰，如期救出了被俘者，但统治者抢先一步截走了缪西卡。为救缪西卡，爱默森中弹身亡。临死前，他向年轻人们表达了希望将来不同种族能和平共处的心愿。悲伤的战士们忽然发现佐尔不见了。此时，再次登上红色机甲的佐尔正循着他记忆中的路线独自杀向旗舰深处，复仇的怒火在他的胸中升腾。
