2つの日常が交差するとき、世界に新たなる非日常が生まれる― 都立ツツジ台高校。 放課後の教室で、響裕太は記憶の中にあるはずのグリッドマンをノートに何度も描いては消していた。 かつてこの世界はひとりの少女によって作られ、壊された。 その少女の心を救ったのは、異次元からやってきたハイパーエージェント・グリッドマンと、彼女が作った心を持った怪獣、そして裕太たちであった。 2年生に進級し、六花と別のクラスになった裕太は告白を決意する。 そんな平和になった世界で過ごす彼らの日常は、轟音と共に崩れ始めた。 裕太に訪れる危機の最中、突如現れるグリッドマンは語りかける。 「この世界のバランスが崩れようとしている」 やがて真紅の強竜ダイナレックスや、グリッドマンの協力者である新世紀中学生、そして別世界の住人、麻中蓬たちも裕太の前に次々と現れる。 六花への想いを秘めたまま、裕太の非日常が始まった。
A year has passed since the events of SSSS.Gridman. The world is at peace and no one except for Rikka and Utsumi remembers the kaiju, Gridman, or Akane Shinjou. This includes Yuuta, who despite serving as Gridman's host, has no memory of the most important moments of his life. So when a new Kaiju appears, he leaps at the chance to prove to himself that he too can be the hero by merging with Gridman once more
Ha pasado un año desde los acontecimientos de SSSS.Gridman. El mundo está en paz y nadie, excepto Rikka y Utsumi, recuerda al kaiju, Gridman o Akane Shinjou. Esto incluye a Yuuta, quien a pesar de ser el anfitrión de Gridman, no recuerda los momentos más importantes de su vida. Entonces, cuando aparece un nuevo Kaiju, aprovecha la oportunidad para demostrarse a sí mismo que él también puede ser el héroe fusionándose con Gridman una vez más.