前橋地裁第一支部に赴任した裁判官・安堂（松山ケンイチ）。幼い頃、精神科医・山路（和久井映見）から自閉スペクトラム症（ＡＳＤ）と注意欠如多動症（ＡＤＨＤ）の診断を受けた彼は、その特性を周囲に隠している。ある日、市長が襲われる傷害事件が発生。被告人・江沢卓郎（小林虎之介）は罪を認めるはずが、初公判で一転して否認。その急変に違和感を覚えた安堂は、特性ゆえの衝動と格闘しながら、事の真相を調べ始める。
傷害事件を起こした高校バスケ部員・栗田奈央（山時聡真）の弁護を担当することになった小野崎（鳴海唯）。当初は栗田の主張する正当防衛を信じるが、目撃者の証言に違和感を覚え、現場へ調査に向かう。そこで不審者扱いをされていた裁判官・安堂（松山ケンイチ）と偶然に遭遇。二人は同じ疑問に行き着いていたが、その先に待っていたのは被告人・栗田に不利な真実だった。小野崎は依頼人の利益を守るか、真実を取るかで揺れ動く。
八御見運送のドライバー・佐久間が、業務中の事故で通行人も巻き込み死亡。娘の四宮絵里（伊東蒼）は、過重労働が原因だとして会社を相手に民事訴訟を起こすが、会社側は佐久間の過失を主張。四宮の弁護人・穂積（山本未來）は、「伝説の反逆児」と呼ばれた裁判長・門倉（遠藤憲一）の訴訟指揮に期待する。一方、安堂（松山ケンイチ）は自らの特性ゆえのミスで公判に影響を及ぼしてしまい、裁判官を続けるべきか悩みはじめる。
第３話に続き、運送会社ドライバーが起こした事故原因をめぐる裁判。会社側の責任を示す新証拠が見つかり、審理は原告・四宮（伊東蒼）に有利に動くかに見えた。だが、運送会社の背後に国の息がかかった外郭団体の影がちらつき、最高裁事務総局からも「悪目立ちするな」と警告された門倉（遠藤憲一）は、訴訟指揮に迷いを見せ始める。そして、辞表をデスクにしまい続ける安堂（松山ケンイチ）に、思いがけない言葉をかけ・・・。
執行官・津村（市川実日子）が、強制立ち退きを催告するためベトナム人・グエンのアパートを訪れた際、グエンに刺される傷害事件が発生。書類に基づく判断を重視するエリート判事補・落合（恒松祐里）は、自らが判を押した立ち退き命令は適切で、責任は注意不足だった津村にあると主張。一方、人の証言を重視する安堂（松山ケンイチ）は、裁判所主導でグエンが刺した動機解明を提案するが、落合はその主張に強く反発し・・・。
一家４人が惨殺された「前橋一家殺人事件」。逮捕された秋葉一馬には死刑判決が下され、死刑が執行された。事件から２５年、秋葉の娘・吉沢（齋藤飛鳥）が父の無罪を訴え、新たな証拠を手に再審を求めていた。再審開始を認めるか否か、その審理に関わるべきか葛藤する安堂（松山ケンイチ）の脳裏に、封じてきた苦い記憶がよみがえる。それは、かつて秋葉に死刑を求刑した検察官・結城（小木茂光）との、消せない過去だった。
検察が証拠を開示しないために行き詰まる再審請求審。裁判長・門倉（遠藤憲一）は職権主義を持ち出し、異例にも裁判所主導で新たな証拠を見つけると決断。一方、裁判所には、事件に関わるかもしれない情報が寄せられる。その中で、明らかに関連がなさそうな別の事件の情報が気になった安堂（松山ケンイチ）は、小野崎（鳴海唯）と共に被害者の父・羽鳥（田辺誠一）を訪ねる。しかし調査を進める最中、予期せぬ連絡が入り・・・
結城（小木茂光）は、精神科医・山路（和久井映見）に何かを伝えようとしていた。その事実を知った安堂（松山ケンイチ）は、結城が残した手がかりをもとに、前橋一家殺人事件との接点を探り始める。安堂の精神状態を案じた小野崎（鳴海唯）は調査に同行。前橋地裁第一支部、弁護団、検察がそれぞれの立場から真相に迫る中、真犯人の存在が浮かび上がり、徐々に点と点がつながっていく。そしてついに、再審請求の決議の日を迎える。
