Makoto and Hinata move back to Kazune after being gone for ten years. They move because their mother has disappeared and that is the last thing she told Makoto to do. They reunite with only friends and meet new ones. Things seem to be going fine until Makoto encounters a strange girl on a train who seems to disappear into thin air. He also encounters an old friend he made a promise to long ago.
Makoto et sa sœur Hinata retournent dans la ville de leur enfance afin d'honorer une promesse faite à leur mère. Sur place, ils retrouvent Tsutomu et Shikohin après 10 ans d'absence. Makoto espère bien retrouver sa mère dans cette ville, mais rapidement ses préoccupations vont se focaliser sur des phénomènes étranges : Un inquiétant dirigeable qui survole la ville ou encore une jeune fille aux cheveux argentés assise seule dans un tramway nocturne sans conducteur...
「決して母さんを捜しちゃだめ」それだけ告げて母が突然姿を消した。丘野真とひなたの兄妹は、母の手がかりを求めて、 幼い頃育った"風音市"に戻ってきた。幼なじみの橘勤や紫光院霞は、真たちを暖かく迎えてくれる。
だが夜になると風音市はその装いを一変させた。街からは人の気配が消え、無人の路面電車以外に動くものは何もない・・・。
真はそんな夜の街で一人の不思議な少女と出会うのだった。やがて春休みも終わり、真は勤たちと同じ風音学園に編入された。
その日の放課後、真はどこからか聞こえてきたハーモニカのメロディに思わず足を止める。記憶の中に蘇ってきたのは、 幼い頃にある少女と交わした一つの"約束"。真はハーモニカの音色を探して思わず駆け出していた・・・。
