| Name | First Aired | Runtime | Image | |
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| S16E01 | 上陸！燃える島パンクハザード |
January 6, 2013
Fuji TV
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| S16E02 | 灼熱の戦い！ルフィVS巨大竜！ |
January 13, 2013
Fuji TV
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| S16E03 | 一味騒然！衝撃の首だけ侍登場！ |
January 20, 2013
Fuji TV
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| S16E04 | 驚愕！遂に明かされる島の秘密 |
January 27, 2013
Fuji TV
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| S16E05 | 子供たちを救え！一味戦闘開始 |
February 3, 2013
Fuji TV
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| S16E06 | 剣術勝負ブルックVS謎の胴体侍 |
February 10, 2013
Fuji TV
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| S16E07 | 七武海！トラファルガー・ロー |
February 17, 2013
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| S16E08 | 大ピンチ ルフィ極寒の湖に沈む |
March 3, 2013
Fuji TV
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| S16E09 | 激突！ローVSスモーカー中将 |
March 17, 2013
Fuji TV
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| S16E10 | 2年ぶりの再会！ルフィとロー |
March 24, 2013
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| S16E11 | 世界最悪 恐怖の科学者シーザー |
March 31, 2013
Fuji TV
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| S16E12 | チョッパー激怒 M非道なる実験 |
April 14, 2013
Fuji TV
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| S16E13 | 一味抹殺！伝説の殺し屋来襲！ |
April 21, 2013
Fuji TV
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| S16E14 | ナミを救え！ルフィ雪山の戦い |
April 28, 2013
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| S16E15 | 結成！ルフィ・ロー海賊同盟！ |
May 5, 2013
Fuji TV
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| S16E16 | M(マスター)を捉えろ 海賊同盟作戦開始 |
May 12, 2013
Fuji TV
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| S16E17 | 全滅の危機 死のモンスター飛来 |
May 19, 2013
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| S16E18 | 大激戦 シーザー真の能力発動！ |
May 26, 2013
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| S16E19 | 炎切り裂く侍！狐火の錦えもん |
June 2, 2013
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| S16E20 | 衝撃！謎の男ヴェルゴの正体！ |
June 9, 2013
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| S16E21 | 子供達を守れ！迫るMの魔の手 |
June 16, 2013
Fuji TV
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| S16E22 | 新世界激震 シーザー悪夢の実験 |
June 23, 2013
Fuji TV
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| S16E23 | 史上最悪の殺戮兵器！シノクニ |
June 30, 2013
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| S16E24 | 反撃開始！ルフィ、ロー脱出 |
July 7, 2013
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| S16E25 | めざせR棟！海賊同盟快進撃 |
July 14, 2013
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| S16E26 | たしぎの涙 G-5決死の突破作戦 |
July 21, 2013
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| S16E27 | 裏切りの中将！鬼竹のヴェルゴ |
July 28, 2013
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| S16E28 | 白熱の激戦 ルフィVSシーザー |
August 11, 2013
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| S16E29 | 闇の黒幕！ドフラミンゴ動く |
August 18, 2013
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| S16E30 | ルフィ凍死！？恐怖の雪女モネ！ |
August 25, 2013
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| S16E31 | ぶつかる拳！二人の中将の戦い |
September 1, 2013
Fuji TV
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| S16E32 | 小さなドラゴン！モモの助現る！ |
September 8, 2013
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| S16E33 | 吹雪の死闘 麦わらの一味VS雪女 |
September 15, 2013
Fuji TV
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| S16E34 | 奥義炸裂！ゾロ最強の一刀流！ |
September 22, 2013
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| S16E35 | 友達を守る！モチャ命がけの逃走 |
September 29, 2013
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| S16E36 | 茶ひげ悲痛！ルフィ怒りの一撃 |
October 6, 2013
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| S16E37 | 衝撃の決着！白猟VSヴェルゴ！ |
October 13, 2013
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| S16E38 | シーザー撃破！最強の灰熊銃(グリズリー・マグナム)！ |
October 20, 2013
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| S16E39 | 襲来！ドレスローザからの刺客 |
October 27, 2013
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| S16E40 | 大暴れ！無敵のフランキー将軍 |
November 3, 2013
Fuji TV
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| S16E41 | 絶体絶命！パンクハザード大爆発 |
November 10, 2013
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| S16E42 | シーザーを捕獲せよ 将軍砲炸裂 |
November 17, 2013
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| S16E43 | 感動の再会！モモの助と錦えもん |
November 24, 2013
Fuji TV
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| S16E44 | 惜別の時 パンクハザード出航！ |
December 1, 2013
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| S16E45 | G5壊滅！ドフラミンゴ急襲！ |
December 8, 2013
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| S16E46 | 緊迫！青キジVSドフラミンゴ |
December 15, 2013
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| S16E47 | 消えたシーザー！海賊同盟出撃 |
December 22, 2013
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| S16E48 | ルフィ海に死す！？海賊同盟崩壊 |
January 5, 2014
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| S16E49 |
大逆転！炸裂ルフィ怒りの鉄拳
season finale
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January 12, 2014
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