アメリカから日本に向かう飛行機で、偶然隣り合わせた後藤英雄（東山紀之）と小向桃子（多部未華子）。「少年隊」のDVDに見入る“ヒガシ”そっくりの後藤は、かつて「アミー＆ゴー」というグループでデビューしたことのあるアイドルで、芸名を“ファイヤー後藤”に変えて再デビューすることが決まったばかり。「これで長年の夢がかないます」と嬉しそうに話す後藤を、桃子は不思議そうにみつめるのだった。 そんな折、機内で急病人が発生！研修医の桃子は、患者のようすから『小脳出血』を疑い、「一刻も早く緊急着陸し、病院に運ばないと患者の命に関わる」と乗務員に告げる。騒然となる機内の乗客たち…。ところが、患者をひと目見た後藤は、涼しげな顔。桃子に的確な指示を出し、あっという間に患者を治してしまった。「あなた、医者ですか？」との桃子の問いに、「医者じゃない、ダンサーだ」と答える後藤…。 数日後、桃子は期待に胸を弾ませ、英仁大学付属名峰病院の総合診療科（通称：ソウシン）へと赴任してきた。アメリカでは最先端の医療分野である「総合診療科」。ところが、名峰病院のソウシンはといえば、落ちぶれた医師の吹き溜まりだった。 上昇気流に乗っていたが、度重なる浮気が原因で離婚、左遷させられやってきた部長の氷室慎太郎（椎名桔平）、ソウシンの“冠婚葬祭部長”で元消化器内科医の漆原誠司（生瀬勝久）、“切りたがり救命医”と噂されソウシンに追いやられた町谷玲奈（小池栄子）、対人恐怖症のレッテルを貼られたオタクの元病理医・後田淳（吉沢悠）…。看護師の本木健介（大倉忠義）も見放すほどの
名峰病院では、業績の上がらない総合診療科のリストラ話がさらに進み、新たなリストラ候補として冠婚葬祭部長・漆原（生瀬勝久）の名前が上がる。漆原は、事務長・曽根（八嶋智人）や後藤英雄（東山紀之）に泣きつくのだが、まったく相手にされない。唯一、桃子（多部未華子）だけが、まるで保護者のように漆原の力になろうとする。 そんな中、後藤は病院の庭で、漆原の息子・颯太（岸本慎太郎）と出会い、ダンスを教える。颯太は、家庭では威張っている父親が、病院でバカにされていることを知り、強く反発していた。 リストラの危機にさらされ、いつになくどんよりとした空気を醸し出す漆原の診察を受けることになった患者は、平憲一（小林隆）50歳。1ヶ月以上続く体調不良を訴える平を「低血糖」と診断した漆原は、その対処としてブドウ糖を注射する。ところが、注射後に痙攣（けいれん）が起きたため、痙攣を抑える薬を注射すると、今度は呼吸が止まってしまった！焦った漆原は、誤って呼吸器の挿管を食道に行ってしまうという大失態を犯し、駆けつけた玲奈（小池栄子）の適切な処置によって、なんとか危機的な状態を回避する。“低ナトリウム”であることが判明した平には、「肺ガン」か「髄膜炎」の可能性が浮上。ソウシンのメンバーは、病名の特定を急ぐのだが…。 4日後、意識を取り戻した平は、自分は医療コンサルタントであることを明かし、漆原を「有名病院に部長待遇で招きたい」と言い出す。漆原は、半信半疑ながらも有頂天になり、院長の大山（大和田伸也）に辞表を提出して…！？
このところ思いつめていた様子の医師・町谷玲奈（小池栄子）が、突然「退職願」を出した。小向桃子（多部未華子）は、氷室慎太郎（椎名桔平）をはじめとするソウシンのメンバーに、玲奈を引き止めるよう頼むのだが、誰に相談してもまったく役に立たず、漆原誠司（生瀬勝久）に至っては「辞表は院長（大和田伸也）に直接出したほうが早く辞められるよ」などと本人に向かって言い出す始末。 そんな玲奈が病院を去ろうとしたその時、事故が起きた。後藤英雄（東山紀之）と玲奈の目の前で車が木に激突し、滝広美和子（片桐はいり）が頭から大量の血を流してよろよろと降りてきたのだ…。幸い大事には至らなかった美和子だが、元々ソウシンへの受診を希望していた患者だということもあり、救命からソウシンへ運ばれることに。そんな中、玲奈はたまたま以前勤めていた病院の先輩医師・井上（光石研）と出くわす。井上は、わざと周りの医師たちに聞こえるような声で「患者の処置はしなかっただろうな？君は、誤診して患者を切ると有名なんだから」と、玲奈を笑いものにする。 事故を目撃してしまった責任感もあり、玲奈は美和子の容態がはっきりするまで病院に残ることを決める。患者の病状は、原因不明の微熱、腹痛、咳。診察も済み、腹痛がおさまった美和子は「仕事があるので一刻も早く帰りたい」と玲奈を急かす。虫垂炎（盲腸）なのか…エコーを手にした玲奈が疑いを持ったそんな折、美和子が突如、意味不明の言葉をまくし立てはじめて…！？
なんと、名峰病院にテレビ番組への出演オファーが届いた。後藤英雄（東山紀之）は「ついにメジャーデビューだ」と大喜び！ところが、出演依頼があったのは、『これが日本のドクターだ！』という総合診療科を扱った真面目な医療バラエティ番組だった…。勝手に“テレビでダンスを披露できる”と思い込んでいた後藤は、「踊りNG」と聞き、激しく落ち込む。 すったもんだの末、テレビには部長・氷室慎太郎（椎名桔平）が出演することになった。名峰病院の評判を上げ、リストラを回避することを目論んだ小向桃子（多部未華子）は、後藤をバックステージにスタンバイさせ、“イヤホンを通じて出題されたクイズの正解を氷室に伝える”という作戦に出た。後藤の力を得て見事に正答を言い当て、気分のアガってしまった氷室は「私がミスターGMです」とその名を全国にアピール。さらにその直後、「なんで自分にスポットが当たらないのか」と、業を煮やした後藤がスタジオへ乱入！！「アミー＆ゴーは不滅です」とアピールするも、スタッフに取り押さえられ、テレビ局から出入り禁止を言い渡されるはめに。多大なるショックを受けた後藤は、ひとり備品室に閉じこもってしまう。 後日、「テレビ番組を見た」という患者たちが、氷室の診察を希望して総合診療科へ詰め掛ける。シックロール（※）らしき患者も多く殺到する中、墨田栄子（あめくみちこ）という女性患者もまた、“氷室目当て”に名峰病院へやってきた。これまで数々の病院で診察を受けるも、全身を襲う痛みの原因が特定されず途方に暮れていた栄子だったが、“氷室なら自分の病気を解明
後藤英雄（東山紀之）ことファイヤー後藤が、「新生アミー＆ゴー」のコンサート会場を決めてきた。本格的にチラシまで作り、ひとり盛り上がっている後藤に対して、いつのまにかメンバーに選ばれていたソウシンの面々は困惑。「どうなってるんだ？」と小向桃子（多部未華子）を囲んでつるし上げる。だが、開き直った桃子は「起こってしまったことはしょうがない」と、まったく踊る気のないソウシンのメンバーたちを一喝。ナイーブな後藤が事実を知って深く傷つくのを恐れ、後藤に診察をさせまくって“ダンスのことを忘れさせよう”と目論む。 そんなこととはつゆ知らず、桃子に「リーダー」と呼びかけられた後藤は、その言葉の響きに感激！気をよくして、驚異的な数の診察をこなし始める。その患者の中に、ある高校の女子ソフトボール部キャプテン遠藤彩夏（木南晴夏）がいた。炎天下の部活中、突然ばたりと倒れて笑いが止まらなくなってしまったという彩夏には、発作、発汗著明、微熱の症状がみられたため、最初は熱中症ではないかと思われた。しかし、“気分の激しい落ち込みと高揚”があることから「躁うつ病」を疑った桃子は、彩夏に精神科への受診を薦めることに。ところが、彩夏は研修生である桃子を「補欠の小娘」呼ばわり。その場は本木健介（大倉忠義）がなんとか収めて事なきを得るも、２人の間には気まずい雰囲気が流れる。 その後も彩夏は、動悸がして倒れたり、パニック症状を起こしたりを繰り返して運ばれてくるのだが、すべて病院に着いた時には症状がおさまっているため、なかなか病気の正体がつかめない。5日後に
あろうことか週に一度、町谷玲奈（小池栄子）の左遷の原因を作った医師・井上洋介（光石研）が、名峰病院の消化器外科に「VIP待遇で出入りしている」と判明。そんな中、井上のもとへやってきたVIP患者のひとりが喘息らしき症状を訴え、ソウシンでも診察することになった。 その患者の名前は、小島啓太（袴田吉彦）。経済誌の表紙なども飾る、『時代の寵児』と揶揄されるIT系ベンチャー企業社長だ。小島は、3ヶ月前から “食べ物が飲み込みにくい”などの嚥下障害と胸の痛みが出始め、徐々に悪化したことから消化器科を受診。胸部CTで食道に大きな腫れが見つかったなどの理由から、井上によって「食道癌の可能性がある」と診断され、一週間後にオペを控えていた。しかし、小島のCT画像を見た後藤英雄（東山紀之）は、「この患者は癌ではない」と直感。部長の氷室慎太郎（椎名桔平）もそれに同意するが、患者本人も手術を了承している上、消化器外科を敵に回してまで中止を申し入れるだけの根拠が見当たらない。 小島の発作的に悪化する胸の痛みは激烈を極め、通常の鎮痛剤は効かない様子。刻一刻と手術予定日が迫るなか、喉の痛み、喘息に加え、原因不明の脱力症状など更なる症状が小島を苦しめて…！？
「ほんとは何がしたいんだ？」と問われ、考え込んでしまった部長・氷室慎太郎（椎名桔平）は、コンサートの話を切り出す後藤英雄（東山紀之）に対し“自分はズーの元メンバーではない”と明かしてしまう。後藤に詰め寄られた桃子（多部未華子）は、「コンサートの日程が迫り、プレッシャーがかかったからではないか」とごまかすも、戸惑いを隠せない。そんな折、院長・大山剛三（大和田伸也）のもとに、氷室の元妻・多恵（清水美沙）が仕事で訪れていたのを漆原（生瀬勝久）が目撃。その情報を聞いた桃子、後田淳（吉沢悠）、本木健介（大倉忠義）は氷室のもとへ向かい、「多恵とよりを戻せたらダンスを踊る」ことを無理やり約束させる。さらに、多恵の説得を試みる桃子たちだったが、多恵は「氷室自身が変わらなければ、復縁の可能性はない」ときっぱり。桃子は、氷室を「立派な医師に変えよう」と心に誓う。 そんなある日、ソウシンに新たな患者がやってきた。昨夜ERに運び込まれたというその患者の名前は、小暮幸一（温水洋一）。小さな鉄工所を経営しているというこの患者は、「気付いたら線路の上で寝ていた」らしく、電車に轢かれそうになって慌てて飛びのいたところ、土手から転落したらしい。患者がこの 1年で3回外傷で来院していることや、本人の言い分に曖昧な点があることなどから、ソウシンの医師たちは自殺未遂を疑うが、担当となった氷室は「工場の納期が迫っていて早く帰りたい」という小暮の言葉を受け、外傷の手当てだけしてあっさりと帰してしまう。 小暮の工場は、経営悪化のため先日リストラを行ったばかりで、従
後藤英雄（東山紀之）が企画した『新生アミー＆ゴー』のコンサートが目前に迫り、名峰病院の医局では、漆原誠司（生瀬勝久）、町谷玲奈（小池栄子）、後田淳（吉沢悠）らが小向桃子（多部未華子）にダンスの練習を強いられていた。 そんな中、氷室慎太郎（椎名桔平）の元妻・多恵（清水美沙）が高熱で倒れ、全身の倦怠感、咽頭痛を訴えてソウシンの診察室へ運び込まれる。さらに、多恵と同じような症状を訴える患者やスタッフ、付き添い人が続出！「院内感染の疑いもある」と、病院内は騒然となる。 さらに、騒動のさなか、事務長・曽根智雄（八嶋智人）の陰謀によって、名峰病院の所有権が上海ウエストメディカルセンターに売却され、院長の大山剛三（大和田伸也）が解任されるというゆゆしき事態が発生。曽根は、水面下で中国のリネンメーカーと手を握り、ソウシンを含む採算の合わない部署を廃止して、新たに富裕層向けの人間ドッグを作ることを前々から企んでいたのだ…。 理事に昇格した曽根から「これが最後の仕事だ」と言い渡されたソウシンのメンバーたちは、全力で「院内感染」の原因究明に奔走することになる。インフルエンザか、SARS（サーズ）か…情報が錯綜し、ますます混乱する状況下で、ついには桃子までもが倒れてしまい…！？ 果たして名峰病院、そして総合診療科の運命とは？そして、後藤はコンサートのステージに立つことができるのか？感動の最終回！！乞うご期待