Gamedeus Cronus has grown massive and become the strongest Last Boss! The Gamedeus Virus expanded and the pandemic has gotten worse. The Gamedeus Virus can now be transferred from person to person, turning the infected into Bugster Virus foot soldiers! Two Bugsters witnessing this symptom, Parado and Poppy Pipopapo, decide to take action. "There is something that only us Bugsters can do…" Poppy says as she rushes to Ex-Aid…
ゲムデウスクロノス打倒の先にあったのは、最悪のゲームステージだった。ゲムデウスクロノスはその身体を肥大させ最強のラスボスへと姿を変えた。さらにはゲムデウスウイルスのゲーム病の被害も拡大し、パンデミックはさらに悪化していた。人から人へと感染するようになったゲムデウスウイルス。その状況を目撃するバグスターが２人いた。ポッピーピポパポとパラドだ。
「私たちバグスターにしかできないことがある」
ポッピーはそう言うと、エグゼイドのもとへ走り出して―――。
