以时辰、季节、年份等节律为单位，讲述了红花、藏红花、红曲、天麻、霜桑叶、陈皮，在采摘、贮藏、炮制过程中与时间的精妙配合，展现时间赋予生命的不同涵义。
无论是神农尝百草，还是李时珍著医书，对中医药的发掘起源于人们延续生命的渴求。年华永驻，青春不老，是人类自古以来的理想。故而本草中的上品，总是滋补之药。耳熟能详的名字，伴随着千年神话代代相传，与其缔造者一起见证人间冷暖，岁月迁徙。 本集关注中药在疗效方面的所长，涵盖石斛、灵芝、凉茶、珍珠、膏方共五个故事，涉及美容驻颜、养生、治未病，同时从药工年华老去延生出去，将“上医治未病”的理念拓展到中药文化和技艺的传承之上。
本集通过讲述附子、何首乌、芡实和龙血树的故事，去探寻本草“化毒为药”、“生熟异治”、“药食同源”、“双向调节”的两面性，以及背后渗透的中国传统文化中辩证统一的哲学思想。
本集通过讲述野山参、甘草、白芍、地黄、化橘红、阿胶的故事，让人们领略孕育本草的自然之境，相逢品相至佳的道地药材，亦可体会至臻至善的匠人之境。
本草成千上万，常用中药就有600多种。每一味中药都有各自的性状和功效。中医通过“君臣佐使”的配伍，调和四气五味，让药与药的配合，发挥最大的功效。
收官篇《根脉》将聚焦华夏大地“山、水、田、漠”四种不同地理环境中孕育出的8种本草，描绘一幅本草地图，使之成为中医药文化的一张名片，不朽流传。
解密抗疟新型药青蒿素的科研之路，看大众眼中的“慢郎中”何以成为急救法宝，探究中药的复方制剂是否真能抵御绝症、予人新生？
无论是农村还是城市，古老的记忆正在与人们渐行渐远。千年本草，面临着前所未见的沉浮巨变。是重生的机遇？还是跨不过去的门槛？
世间的你来我往，生命的繁荣共进，皆因“有情”而有了聚散离合，有了冷暖温度。与本草的情发乎于生命，应乎于天地，顺乎于道义。
拍摄《本草中国》的这段时间，摄制组的年轻人感受到了很多、收获了很多，从千年智慧的中医本草、到博大精深的中华文化，而最重要的，他们在过程中，更找到了自己。
同一种本草，既是美食，又是良药。 所谓“药食同源”，许多食物即药物，古代医学家将中药理论运动到食物之中，认为食物也是具有“四性”、“五味”。在本集里我们着重选取那些人们司空见惯的食物，观众可能了解它的美味，但却并不知它在疾病治疗当中的妙用。
同一种植株，不同部位入药，产生不同疗效。 本来是同一株植物，因为入药部位不同，疗效会完全不同，甚至大相径庭，对普通患者而言，对这些可能根本分不清楚，用药过程中也经常会 出现笑话或者产生危险耽误病情。我们要集中拍摄不同本草的生长成熟过程，以及植物不同部位分别用作不同的药物的过程，在一个个具体的不停应用的治病场景，展现本草这些不为外人所知的奥秘。
同一种本草，既是虫子，又是良药。 昆虫作为药物治病，在我国已有 2000 多年的历史。到目前为止，我国中医的药用昆虫达 300 种之多。本集将采用特种摄影手段拍摄昆虫生态以及其入药治病的过程。
上古《神农本草经》记载，神农尝百草，日遇七十二毒，人类对本草的认知体系正是在一次次毒与药的分辨中建立完善起来。在高明的医者眼中，药物的毒烈特性也许正是某种顽疾的克星，药物毒物，宛如一枚硬币的两面，夺命救命，均在一念之间。
同一种本草，不同配伍，不同疗效。 前人把单味药的应用及药物之间的配伍关系概括为七种情况，称为”七情”，除单行外，皆从双元配伍用药角度论述单味中药通过简单配伍后的性效变化规律。曰，“药......有单行者，有相须者，有相使者，有相畏者，有相恶者，有相反者，有相杀者。凡此七情，全和视之”。同一味药，加上不同的配伍，可能药性药效会完全不同。 而另方面，为了达到好的效果，中医在临床用药中，每一味本草也会有 其相对熟悉的好搭档，来共同达到治疗的目的。
同一个相似的名称，不同产地，不同疗效。 两种产地，性味完全不同的药，却有着相同相近的名字，他们到底如何区分，在临床应用中又会产生怎样的效果?对于普通观众而言，这些名 字似是而非，仿佛很接近但是实则区别很大，外行可能不知其所云，非容易混淆。名字的由来可能是在当地历史上约定俗成的，里面带着不同的历史和文化积淀，两种本草之间似乎存在着千丝万缕的联系，但是在实际临床使用当中容不得半点含糊。
在本草的世界当中，绝大部分药材来自于植物。而作为植物的根脉，这座最容易被忽视但却每时每刻都在运化生产的地下工厂，更多时候，他们的价值只有在本草世界中才能被世人认知。
本草的世界是博大多彩的，人类身处庐山却不知其真面，日常司空见惯的事物，却是医者信手拈来的灵丹妙药，不妨跳出常规的思维定式，来本草的世界里，拾取那一份被你我遗忘忽略的记忆。
同一种本草，经历不同炮制，产生不同疗效。 中药必须经过炮制之后方可入药，这是中医用药的特点之一。中药炮制 是根据中医药理论，依照辨证施治用药的需要和药物自身性质，以及调 剂、制剂的不同要求，所采取的制药技术。不同的药物，有不同的炮制目的;概括地说，中药炮制的目的只有四个字:减毒增效。同一种药材 经历不同的炮制会产生不同的疗效，炮制有多种方式，主要有三类即以 水制、火制、水火共制为纲，统领各种中药的炮制。
同一种本草，不同剂量剂型用法，不同疗效。 一味本草，当最终成为医生治病救人的良药，需要经过一个漫长的过程。即使药物选定了，但是因为药物的用量不同，剂型不同，服用方式不同，也会产生截然不同的效果。所有这些指标都会因人，因地，因时，因症候不同，做出相应的变化，变化不同，疗效就不同。在中医的临床中，中药的剂量往往关乎治疗的成效，颇受医者重视，剂量往被视为“不传之秘”。
面对来路各异，病情各异的病人，经验丰富的老中医却开出了同一个药方，在这同样的几味药的作用下，竟然都痊愈了。很多老中医一辈子经常使用的只有一两个药方，却治好无数疑难杂症，所谓殊途，是指殊途同归，不同的病征归结到一种治疗方案上面。宇宙在运转，世界在变化，生命在成长，中医是一种科学，更是一种哲学，同一个药方，在医者手中，可以治愈不同之病，同样的病情，截然不同的治疗策略。
这是一个高速变化运转的时代，伴随生活方式的演变，生态环境的恶化，人类的健康也将受到前所未有的全新的挑战。无论是古老的中医，还是年轻的西医，他们都是人类健康的守护神。在未来的时空中，如何实现医学的跨文化沟通，更进一步破译天地间的生命密码，传承济世救民的使命，这是担负在一代医者肩上的伟大使命。