Hitomi holt Van nach dem Kampf gegen die Zaibacher Gaimilefs aus dem Reich der Toten zurück. In der nächsten Nacht greifen die beiden Leopardenfrauen Eria und Naria mit ihren Gaimilefs im Auftrag der Zaibacher den Krusador an. Van kann sie nicht aufhalten, doch Merle stellt sich ihnen in den Weg. Eria und Naria ziehen sich vorübergehend zurück. Aufgrund der Aufzeichnungen von Allens Vater glaubt Dryden, daß der Schlüssel aller Geheimnisse um Atlantis im Mystischen Tal verborgen liegt. Sofort macht sich der Krusador auf den Weg dorthin.
Van is enveloped into the world of the dead, and Hitomi goes to retrieve him -- but not before envisioning the destruction of Atlantis. The previous battle's trauma disorients Dilandau as well, so Folken sends out Naria and Eriya (the intensely loyal leopard girl twins who directly answer to him) to continue the mission of capturing the Escaflowne.
Plongé dans les ténèbres, Van ne parvient pas à sortir du cockpit d'Escaflowne. En essayant de le sauver, Hitomi se retrouve avec lui au Royaume des Ombres. Pendant ce temps, Dornkirk ordonne à Folken de s'emparer d'Escaflowne. Folken envoie alors les soeurs Narya et Eirya au combat...
Van ritorna dal mondo dei morti, ma non è più in grado di impugnare la spada. Due nuovi nemici a bordo di Guymelef d'oro e d'argento arrivano all'attacco.
死者の世界に引き込まれたバァンを取り戻すために、ひとみは命懸けで死者の世界へと臨む。メルルの呼び声をたよりに死者の世界から生還し意識を取り戻したが、バァンは深層意識に植え付けられた恐怖により、剣を振るえなくなってしまっていた。
バァンを案じるひとみにアレンは、バァン自身を鍛えるしかないと話すのだった。そんなアレンに自分の好意を口にするひとみ。航行を続けるドライデンの空中浮遊商船の中では、ひとみとアレン、ミラーナとドライデンがそれぞれ急接近し、恋愛模様が展開し始める。
ほどなくひとみは、ミラーナからアレンとドライデンについて、恋の相談を受けるのだった。
そこへザイバッハ帝国の金銀２体のガイメレフ、テイリングが奇襲を仕掛けてきた。バァンはエスカフローネで迎え撃つが、戦う事への恐怖に囚われ窮地に陥ってしまう。
メルルの決死の行動で敵は撤退、バァンは危機を脱する。
ドライデンはアレンの父が残した手記により、これまでに起きた出来事の謎を解く鍵が幻の谷と呼ばれる「アトランティスの谷」にあることをつきとめる。そして、ひとみ達一行はついに幻の谷へと到着するのだった。
Van se ve envuelto en el mundo de los muertos, y Hitomi va a buscarlo, pero no antes de imaginar la destrucción de la Atlántida. El trauma de la batalla anterior también desorienta a Dilandau, por lo que Folken envía a Naria y Eriya (las gemelas de leopardo intensamente leales que responden directamente a él) para continuar la misión de capturar al Escaflowne.
为了找回被带入死者世界的凡，瞳拼了命前往死者世界。根据梅尔的呼唤从死者的世界生还并恢复了意识，不过，凡因深层意识中植入的恐惧，变得无法挥剑。艾伦对担心范的瞳说，只有锻炼范自己。对那样的艾伦说出自己的好意的瞳。德莱顿的空中漂浮商船继续航行，瞳和艾伦，米勒娜和德莱顿分别急速接近，恋爱的模样开始展开。没过多久，瞳就接到了米勒娜关于艾伦和德莱顿的恋爱咨询。就在这时，扎伊巴赫帝国的金银2尊盖梅列夫、特林发动了奇袭。凡用埃斯卡弗洛内迎击，但被对战斗的恐惧所困，陷入了困境。梅尔的殊死行动使敌人撤退，万恩摆脱了危机。德莱顿根据艾伦的父亲留下的手记，找到了解开至今为止发生的事情之谜的钥匙在被称为幻之谷的“亚特兰蒂斯之谷”。然后，瞳一行人终于到达了幻之谷。
